RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MEDAGQ5VYS4 303 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SYS1Q8N2H4 156 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CASTOR1Q8WTX7 329 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALS12Q96DT0 336 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TOLLIPQ9H0E2 274 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 OAZ3Q9UMX2 235 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SAC3D1A6NKF1 404 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SNTNA6NMZ2 147 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 E9PI62 339 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 NBR2O15453 112 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 FCGR1AP12314 374 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM30BQ3MIR4 351 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf183Q5T699 404 aa21.11■□□□□ 0.97
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR4K15Q8NH41 348 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1L1Q8NH94 360 aa21.11■□□□□ 0.97
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CAPNS1-217ENST00000629983 JAM3Q9BX67 310 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
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CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-11P01762 117 aa21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 RITA1Q96K30 269 aa21.09■□□□□ 0.97
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CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
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CAPNS1-217ENST00000629983 MCRIP1C9JLW8 97 aa21.08■□□□□ 0.97
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CAPNS1-217ENST00000629983 AASSQ9UDR5 926 aa21.07■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 STUB1Q9UNE7 303 aa21.07■□□□□ 0.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf73Q9NVV2 129 aa21.06■□□□□ 0.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 SOX15O60248 233 aa21.05■□□□□ 0.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 STEAP3Q658P3 488 aa21.05■□□□□ 0.96
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CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N1Y9 231 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM106AQ96A25 262 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 NABP2Q9BQ15 211 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 TPSG1Q9NRR2 321 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK13-1Q9NX77 482 aa21.05■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 FADS2O95864 444 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 BDKRB2P30411 391 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC36Q1X8D7 754 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52L2PQ8NGH6 319 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 MORN2Q502X0 79 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf146Q5VVC0 180 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB12Q6IQ22 244 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-217ENST00000629983 MS4A10Q96PG2 267 aa21.03■□□□□ 0.96
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