RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 NICN1Q9BSH3 213 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGEF1-209ENST00000607882 OR1S2Q8NGQ3 325 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGEF1-209ENST00000607882 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.72
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RABGEF1-209ENST00000607882 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10.52□□□□□ -0.72
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RABGEF1-209ENST00000607882 RAB24Q969Q5 203 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-209ENST00000607882 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-209ENST00000607882 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-209ENST00000607882 BANF2Q9H503 90 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0A6YYD4 124 aa10.51□□□□□ -0.73
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