RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 C22orf42Q6IC83 251 aa21.57■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 MOB3BQ86TA1 216 aa21.57■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 GALMQ96C23 342 aa21.57■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 RGS11O94810 467 aa21.56■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 VEGFCP49767 419 aa21.56■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 OR56B1Q8NGI3 324 aa21.56■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 SSR3Q9UNL2 185 aa21.56■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 MGAM2Q2M2H8 2515 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 A0A1W2PPI3 338 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 SOCS1O15524 211 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 TMEM11P17152 192 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 REG1BP48304 166 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 C2orf68Q2NKX9 166 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 MOB1BQ7L9L4 216 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 C11orf44Q8N8P7 122 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 JPT1Q9UK76 154 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 RAB22AQ9UL26 194 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 STUB1Q9UNE7 303 aa21.55■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 A0A0A6YYD4 124 aa21.54■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 ABCA11PQ4W5N1 156 aa21.54■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 C9orf152Q5JTZ5 239 aa21.54■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 FAM89BQ8N5H3 189 aa21.54■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 SERTAD4Q9NUC0 356 aa21.54■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 HSF4Q9ULV5 492 aa21.54■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 MOB4Q9Y3A3 225 aa21.54■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 IFITM5A6NNB3 132 aa21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 TXNL1O43396 289 aa21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 OR10A3P58181 314 aa21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 HTD2P86397 168 aa21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 KCTD21Q4G0X4 260 aa21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 STEAP3Q658P3 488 aa21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 OR52L2PQ8NGH6 319 aa21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 IL1F10Q8WWZ1 152 aa21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 MGAT4AQ9UM21 535 aa21.53■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 IGKV1D-33P01593 117 aa21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 IGKV1-33P01594 117 aa21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 HNF4GQ14541 408 aa21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 MORN2Q502X0 79 aa21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 CFHR4Q92496 578 aa21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 CYYR1Q96J86 154 aa21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 AK3Q9UIJ7 227 aa21.52■■□□□ 1.04
BRD4-208ENST00000597315 SLC31A2O15432 143 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 FBXO24O75426 580 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 CSF1P09603 554 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 HMGN3Q15651 99 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 NEDD8Q15843 81 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 CT45A1Q5HYN5 189 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 LYG1Q8N1E2 194 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 ZNF439Q8NDP4 499 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 CT45A3Q8NHU0 189 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 MMP27Q9H306 513 aa21.51■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 YPEL1O60688 119 aa21.5■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 NAPSAO96009 420 aa21.5■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 GADD45AP24522 165 aa21.5■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 Q6ZS46 218 aa21.5■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 YPEL2Q96QA6 119 aa21.5■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 PECRQ9BY49 303 aa21.5■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 C12orf4Q9NQ89 552 aa21.5■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa21.49■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 SHISA3A0PJX4 238 aa21.49■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 METTL21EPA6NDL7 271 aa21.49■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 ZNF134P52741 427 aa21.49■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 GNMTQ14749 295 aa21.49■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 TMEM95Q3KNT9 176 aa21.49■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 OR2AK2Q8NG84 335 aa21.49■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 OR2T10Q8NGZ9 312 aa21.49■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.49■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 LDLRAD4O15165 306 aa21.48■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 FBLN7Q53RD9 439 aa21.48■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 TPRA1Q86W33 373 aa21.48■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa21.48■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 RAB3CQ96E17 227 aa21.48■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa21.47■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 HSPA12AO43301 675 aa21.47■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 CD3GP09693 182 aa21.47■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 RAB6AP20340 208 aa21.47■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 CD1BP29016 333 aa21.47■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 ZNF137PP52743 207 aa21.47■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 TMEM50BP56557 158 aa21.47■■□□□ 1.03
BRD4-208ENST00000597315 ZNF880Q6PDB4 577 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms