RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GW64 132 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TRDCB7Z8K6 153 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 H0Y980 276 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 J3QT63 122 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 GOSR1O95249 250 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 DBHP09172 617 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 HKR1P10072 659 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 GLI4P10075 376 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 ZNF250P15622 560 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 GLRA1P23415 457 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FCGR2CP31995 323 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 PRDX4Q13162 271 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 RAB32Q13637 225 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 ZNF273Q14593 569 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TMEM187Q14656 261 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TSC22D1Q15714 1073 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 SSX8Q7RTT4 187 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 MDS2Q8NDY4 140 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 ABHD3Q8WU67 409 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 PIGCQ92535 297 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 LRRC46Q96FV0 321 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 GPR160Q9UJ42 338 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GU03 582 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PP11 408 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 C5orf49A4QMS7 147 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 G3V3Y1 287 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 H7C2Y5 167 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TOR1AO14656 332 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 MPPED1O15442 326 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 SIAH2O43255 324 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 PITX3O75364 302 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 ADAP1O75689 374 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TUSC2O75896 110 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 HBE1P02100 147 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 HOXB5P09067 269 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 RAB1AP62820 205 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 DEFA5Q01523 94 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 STX12Q86Y82 276 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 ZNF695Q8IW36 515 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FAM219AQ8IW50 185 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TOMM40LQ969M1 308 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 OR10C1Q96KK4 312 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 RAB40CQ96S21 281 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 GINS3Q9BRX5 216 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 ZNF747Q9BV97 191 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 Q9N2K0 584 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 DEPPQ9NTK1 212 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 SLC22A20A6NK97 555 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 CD300LBA8K4G0 201 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FAM157AC9JC47 383 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-218ENST00000584243 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.81□□□□□ -1.32
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