RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF19Q9NS68 423 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 CXorf65A6NEN9 183 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF519Q8TB69 540 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ORM1P02763 201 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 FCGR3AP08637 254 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ASAH2BP0C7U1 165 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 TEPPQ6URK8 271 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 SFTPA2Q8IWL1 248 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 HARBI1Q96MB7 349 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 SYNGR1O43759 233 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 CD82P27701 267 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 UQCRFS1P47985 274 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM208Q9BTX3 173 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 FABP2P12104 132 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 HOXA6P31267 233 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 IFITM2Q01629 132 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 APELAP0DMC3 54 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 WDFY1Q8IWB7 410 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 OR4B1Q8NGF8 309 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF488Q96MN9 340 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM140Q9NV12 185 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 J3KRW8 73 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 CD40P25942 277 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 MDP1Q86V88 176 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP30Q9Y2G7 519 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 OR4C46A6NHA9 309 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ISLRO14498 428 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ZP4Q12836 540 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 PIPOXQ9P0Z9 390 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 CACNA1CQ13936 2221 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 SMDT1Q9H4I9 107 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 WBP1LQ9NX94 342 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRM-211ENST00000580170 NPY1RP25929 384 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 WNT5AP41221 380 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 COL10A1Q03692 680 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 OR1P1Q8NH06 330 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 C21orf140B9A014 251 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 PLPPR5Q32ZL2 321 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC75AQ8NAA5 344 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CA11O75493 328 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 RTP5Q14D33 572 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF600Q6ZNG1 722 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 OR5AC2Q9NZP5 309 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 KCNK7Q9Y2U2 307 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 OR51B2Q9Y5P1 312 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 LIMS1P48059 325 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 NMUP48645 174 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 NAAAQ02083 359 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 SSX8Q7RTT4 187 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM204Q9BSN7 226 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 RSG1Q9BU20 258 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 F2RL2O00254 374 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 UQCR10Q9UDW1 63 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 Q8WTZ3 238 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 MMP9P14780 707 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 LDLRAD3Q86YD5 345 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 WDR54Q9H977 334 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 INSIG2Q9Y5U4 225 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PPE3 182 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 FSTP19883 344 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 FBXW9Q5XUX1 488 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 RNF224P0DH78 156 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 DLX1P56177 255 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CYB5R2Q6BCY4 276 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 C12orf54Q6X4T0 127 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 REC114Q7Z4M0 266 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 OR5R1Q8NH85 324 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 MOSPD3O75425 235 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 DXOO77932 396 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 UPK3AO75631 287 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 HLA-DQB1P01920 261 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 AREGP15514 252 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 CRXO43186 299 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 SRP14P37108 136 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 FOXL2P58012 376 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 SGMS2Q8NHU3 365 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 TCTAP57738 103 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 VAX1Q5SQQ9 334 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
PTPRM-211ENST00000580170 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms