RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568290.1

ATXN3-250, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-250ENST00000568290 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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ATXN3-250ENST00000568290 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 OR51I2Q9H344 312 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 LIME1Q9H400 295 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 NIT2Q9NQR4 276 aa6.51□□□□□ -1.37
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ATXN3-250ENST00000568290 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 A6NLC8 198 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATXN3-250ENST00000568290 CST7O76096 145 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATXN3-250ENST00000568290 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 COL8A1P27658 744 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATXN3-250ENST00000568290 DCAF10Q5QP82 559 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATXN3-250ENST00000568290 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATXN3-250ENST00000568290 ZFP82Q8N141 532 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 NAXEQ8NCW5 288 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 CORO2AQ92828 525 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 MUCL1Q96DR8 90 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATXN3-250ENST00000568290 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-250ENST00000568290 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.49□□□□□ -1.37
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