RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560514.1

TSPAN3-208, Transcript of tetraspanin 3, human

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN3-208	ENST00000560514	SLC29A1	Q99808	456 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	DHDH	Q9UQ10	334 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514		A0A1W2PN81	502 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	MAGEB3	O15480	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	CHRNA7	P36544	502 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	PIGY	Q3MUY2	71 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514		Q3ZCU0	254 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	TMED9	Q9BVK6	235 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	RAB9B	Q9NP90	201 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	GNG12	Q9UBI6	72 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	AASS	Q9UDR5	926 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TSPAN3-208	ENST00000560514	C15orf65	H3BRN8	121 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	HTR3B	O95264	441 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	RAB3A	P20336	220 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	DCK	P27707	260 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	CST11	Q9H112	138 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	AMBN	Q9NP70	447 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	KIAA1456	Q9P272	454 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	C12orf77	C9JDV5	145 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514		E9PI62	339 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ORC5	O43913	435 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF137P	P52743	207 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ACTB	P60709	375 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	LSAMP	Q13449	338 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	IRGM	A1A4Y4	181 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514		H0Y980	276 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	SLC31A2	O15432	143 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	NBR2	O15453	112 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	SPINT2	O43291	252 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	CD2	P06729	351 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	CD40LG	P29965	261 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	STX19	Q8N4C7	294 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	GPR148	Q8TDV2	347 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	AIP	O00170	330 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	LANCL1	O43813	399 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	LIMS3	P0CW19	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	LIMS4	P0CW20	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	DDB2	Q92466	427 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	EBAG9	O00559	213 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	GABRP	O00591	440 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	OGG1	O15527	345 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	VHL	P40337	213 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TSPAN3-208	ENST00000560514	APH1B	Q8WW43	257 aa		13.66	□□□□□ -0.22

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