RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GPR31	O00270	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF737	O75373	536 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C1QL1	O75973	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IFNA2	P01563	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IFNA21	P01568	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DANCR	P0C864	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IGFBP2	P18065	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	AADAC	P22760	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GLIPR1	P48060	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM33	P57088	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SRPX	P78539	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PAX5	Q02548	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	HMGN3	Q15651	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CCL19	Q99731	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0B4J2A0	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PPE2	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PR64	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PRV1	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		J3QKU1	62 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GOSR2	O14653	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	HSD17B6	O14756	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SNAPC5	O75971	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SFT2D2	O95562	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FSTL3	O95633	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CD8A	P01732	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	HBZ	P02008	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TFF1	P04155	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SOD3	P08294	240 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	COL8A2	P25067	703 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CDKN1A	P38936	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	EFNA4	P52798	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PIGP	P57054	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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