RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551098.5

DDX23-208, Transcript of DEAD-box helicase 23, human

TSL 2

Gene DDX23, Length 1,083 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX23-208	ENST00000551098	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF329	Q86UD4	541 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		13.79	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	MOS	P00540	346 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF134	P52741	427 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	SLC35B1	P78383	322 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	IRF3	Q14653	427 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	LRRC42	Q9Y546	428 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDX23-208	ENST00000551098	UCHL1	P09936	223 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	TRAM1	Q15629	374 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	MORN2	Q502X0	79 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	GALM	Q96C23	342 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	SLC22A1	O15245	554 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	ARL6IP5	O75915	188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	RGS11	O94810	467 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	IGHG2	P01859	326 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	IGLL1	P15814	213 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	CHAT	P28329	748 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	TPBG	Q13641	420 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	BPNT1	O95861	308 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	HSPA13	P48723	471 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF137P	P52743	207 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	HTD2	P86397	168 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	GNMT	Q14749	295 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	P2RY14	Q15391	338 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098		Q8N6K4	173 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	SETD6	Q8TBK2	473 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	CYYR1	Q96J86	154 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	LINC01548	A6NM66	108 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	AP4M1	O00189	453 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	LANCL1	O43813	399 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	YPEL1	O60688	119 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	ARSB	P15848	533 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	CPE	P16870	476 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	CRHBP	P24387	322 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	GPR12	P47775	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	UNC119	Q13432	240 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	STPG2	Q8N412	459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098		Q8N9W7	124 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	CNBD2	Q96M20	576 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	S1PR3	Q99500	378 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDX23-208	ENST00000551098	MGLL	Q99685	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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