RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549076.1

ARFGAP1-222, Transcript of ADP ribosylation factor GTPase activating protein 1, human

TSL 2

Gene ARFGAP1, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARFGAP1-222	ENST00000549076	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RGS10	O43665	173 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IGHG2	P01859	326 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HSMCR30	P0CW71	290 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RANBP1	P43487	201 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF137P	P52743	207 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TRAM1	Q15629	374 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GALM	Q96C23	342 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	AP4M1	O00189	453 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SLC31A2	O15432	143 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ARL6IP5	O75915	188 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	UCHL1	P09936	223 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	VSIG8	P0DPA2	414 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MYF6	P23409	242 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SLC6A1	P30531	599 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IRF3	Q14653	427 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SLC22A1	O15245	554 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LANCL1	O43813	399 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	BPNT1	O95861	308 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IGLL1	P15814	213 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CHAT	P28329	748 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HSPA13	P48723	471 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF134	P52741	427 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HTD2	P86397	168 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TPBG	Q13641	420 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MORN2	Q502X0	79 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	STPG2	Q8N412	459 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076		Q8N6K4	173 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PHF21A	Q96BD5	680 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	S1PR3	Q99500	378 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GPR12	P47775	334 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TM2D1	Q9BX74	207 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	YPEL1	O60688	119 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ARSB	P15848	533 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SOX6	P35712	828 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ARFGAP1-222	ENST00000549076		Q8N9W7	124 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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