RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 SETD9Q8NE22 299 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 NEK7Q8TDX7 302 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 ORAI1Q96D31 301 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 SLC31A2O15432 143 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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LTBR-211ENST00000543190 MORN2Q502X0 79 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.59□□□□□ -0.07
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LTBR-211ENST00000543190 CCDC107Q8WV48 283 aa14.59□□□□□ -0.07
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LTBR-211ENST00000543190 ETAA1Q9NY74 926 aa14.59□□□□□ -0.07
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LTBR-211ENST00000543190 JPT1Q9UK76 154 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 LRRC42Q9Y546 428 aa14.59□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 HLA-DRB1P01911 266 aa14.58□□□□□ -0.08
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LTBR-211ENST00000543190 MGMTP16455 207 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 INSL3P51460 131 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 F2RL1P55085 397 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.58□□□□□ -0.08
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LTBR-211ENST00000543190 OR14A2Q96R54 314 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.58□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 YPEL1O60688 119 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 CAPGP40121 348 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 ST3GAL4Q11206 333 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 FBLIM1Q8WUP2 373 aa14.57□□□□□ -0.08
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LTBR-211ENST00000543190 MUL1Q969V5 352 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 YPEL2Q96QA6 119 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 SCOCQ9UIL1 159 aa14.57□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.57□□□□□ -0.08
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LTBR-211ENST00000543190 VDAC1P21796 283 aa14.56□□□□□ -0.08
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LTBR-211ENST00000543190 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 NPBQ8NG41 125 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 OR4K15Q8NH41 348 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 OR1L1Q8NH94 360 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.56□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 I3L521 148 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 WNT4P56705 351 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 RNLSQ5VYX0 342 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 UBALD1Q8TB05 177 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
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LTBR-211ENST00000543190 GHITMQ9H3K2 345 aa14.55□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
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LTBR-211ENST00000543190 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 PHYHIPQ92561 330 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.54□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 EBAG9O00559 213 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 ITGB1BP1O14713 200 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 CELP19835 753 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 CHATP28329 748 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 HMGN3Q15651 99 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 DEFB136Q30KP8 78 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.53□□□□□ -0.08
LTBR-211ENST00000543190 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.53□□□□□ -0.08
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