RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 SPACA5Q96QH8 159 aa5.95□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GPER1Q99527 375 aa5.95□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR51J1Q9H342 316 aa5.95□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 A0A1W2PPE3 182 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SNTNA6NMZ2 147 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 LDLRAD4O15165 306 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SLC16A6O15403 523 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GYG2O15488 501 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SAP30O75446 220 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GP9P14770 177 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 EPHA2P29317 976 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SSTR5P35346 364 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 REG1BP48304 166 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GYS2P54840 703 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 RSU1Q15404 277 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 LINC00596Q86U02 117 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM104Q8NE00 496 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 DCUN1D4Q92564 292 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ARL11Q969Q4 196 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ISOC1Q96CN7 298 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 IFT22Q9H7X7 185 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 DKK2Q9UBU2 259 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.94□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 FAM90A10PA6NDY2 464 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM212A6NML5 194 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 A8MZ25 164 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 C15orf65H3BRN8 121 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 J3QLW9 94 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR8U9P0C7N5 309 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SPNP16150 400 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF19P17023 458 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 RAB3AP20336 220 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 FASP25445 335 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 RAB9AP51151 201 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF137PP52743 207 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 F2RL1P55085 397 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 FOXI1Q12951 378 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ATP6AP1Q15904 470 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 MPV17LQ2QL34 196 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 NHLRC3Q5JS37 347 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 MEDAGQ5VYS4 303 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ASCL4Q6XD76 172 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SATL1Q86VE3 508 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 STX19Q8N4C7 294 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC197Q8NCU1 140 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR51A4Q8NGJ6 313 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR10AC1Q8NH08 325 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 PELI1Q96FA3 418 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR4C12Q96R67 309 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 S100A13Q99584 98 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 METTL9Q9H1A3 318 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GNB4Q9HAV0 340 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 IL36GQ9NZH8 169 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 DHDHQ9UQ10 334 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 POMPQ9Y244 141 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.93□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TENM3Q9P273 2699 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 LINC01619G3V211 115 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 J3QRE1 110 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GABRPO00591 440 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 SPINT2O43291 252 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 LANCL1O43813 399 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 HLA-DRB1P01911 266 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 FCGR1AP12314 374 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 VEGFCP49767 419 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 GPR176Q14439 515 aa5.92□□□□□ -1.46
C16orf62-212ENST00000540240 ZSCAN26Q16670 478 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms