RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 HS3ST1O14792 307 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SIAH2O43255 324 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 EFNA2O43921 213 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZNF205O95201 554 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 C1orf61Q13536 156 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR5I1Q13606 314 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 COX19Q49B96 90 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 FAM78BQ5VT40 261 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PLCXD3Q63HM9 321 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZNF709Q8N972 641 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 DYRK2Q92630 601 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SDSLQ96GA7 329 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 LRRC61Q9BV99 259 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 C5orf63A6NC05 138 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 FAM166BA8MTA8 275 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 C10orf142B7Z368 130 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 YPEL1O60688 119 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RAB7AP51149 207 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PCBD1P61457 104 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 LEMD1Q68G75 181 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR2M3Q8NG83 312 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 NAT6Q93015 286 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SLC35E1Q96K37 410 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 YPEL2Q96QA6 119 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR4C12Q96R67 309 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ULBP2Q9BZM5 246 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 VSIRQ9H7M9 311 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CCL28Q9NRJ3 127 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.26□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 C2orf72A6NCS6 295 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 H3BP45 60 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 DEGS1O15121 323 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 IGKV1D-12P01611 117 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 JMJD7P0C870 316 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ANOS1P23352 680 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 GFERP55789 205 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 FGF12P61328 243 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 MSMO1Q15800 293 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 FAM180AQ6UWF9 173 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 KMT5CQ86Y97 462 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RASL10BQ96S79 203 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RNF2Q99496 336 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CACNG5Q9UF02 275 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.25□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PNR3 127 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TNFSF11O14788 317 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 DNPH1O43598 174 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 SYNGR3O43761 229 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 LILRA1O75019 489 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CBR3O75828 277 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 ZFAND5O76080 213 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CRISP2P16562 243 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 CHRNB4P30926 498 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 MPLP40238 635 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 Q0VG73 95 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TESK1Q15569 626 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.24□□□□□ -0.93
LMO3-215ENST00000537304 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms