RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 OR4F4Q96R69 305 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PRO3102Q9H379 93 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TOX4O94842 621 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 FBXW4P57775 412 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ACKR1Q16570 336 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 BATF2Q8N1L9 274 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 CLDN23Q96B33 292 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 STARD4Q96DR4 205 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 AMELYQ99218 206 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 RNF114Q9Y508 228 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TAX1BP3O14907 124 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 GDF9O60383 454 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 GABRA2P47869 451 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SRPXP78539 464 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 MUC15Q8N387 334 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ASB10Q8WXI3 467 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR51I2Q9H344 312 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 MED12Q93074 2177 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1W2PQM1 296 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 DIRC3C9JPN6 131 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 MSR1P21757 451 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 IL3RAP26951 378 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SFTPDP35247 375 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 PRRX1P54821 245 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SGCBQ16585 318 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 COMMD2Q86X83 199 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SARAFQ96BY9 339 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ODAMA1E959 279 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 GJE1A6NN92 205 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 OR7C2O60412 319 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 SLC16A7O60669 478 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 NPIPB7O75200 414 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 SCRG1O75711 98 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 MT-ATP6P00846 226 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 IL11P20809 199 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 AADACP22760 399 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ASCL1P50553 236 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 SELENOVP59797 346 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 RTP5Q14D33 572 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ATP6V0BQ99437 205 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 VDAC3Q9Y277 283 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 PRSS37A4D1T9 235 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ZFP92A6NM28 416 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 J3QR06 171 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 KBTBD11O94819 623 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 VSIG8P0DPA2 414 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 HLA-DOBP13765 273 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 CTLA4P16410 223 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 TLE3Q04726 772 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 MSMO1Q15800 293 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 OTOSQ8NHW6 89 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 C8orf44Q96CB5 159 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 PARLQ9H300 379 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 G3V3Y1 287 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 HS3ST1O14792 307 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-209ENST00000519674 ST8SIA3O43173 380 aa7.26□□□□□ -1.25
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