RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516222.1

RNU6-561P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 561, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-561P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-561P-201ENST00000516222 PTPRBP23467 1997 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 EXPH5Q8NEV8 1989 aa-0.76□□□□□ -2.53
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RNU6-561P-201ENST00000516222 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
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RNU6-561P-201ENST00000516222 B4DEV8 164 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 H0Y8G0 127 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 ITGB1BP1O14713 200 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR2T1O43869 369 aa-0.77□□□□□ -2.53
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RNU6-561P-201ENST00000516222 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 SULT1E1P49888 294 aa-0.77□□□□□ -2.53
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RNU6-561P-201ENST00000516222 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
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RNU6-561P-201ENST00000516222 SSX9Q7RTT3 188 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 SCD5Q86SK9 330 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR52E5Q8NH55 327 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM81AQ8TBF8 368 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 CCL17Q92583 94 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 FBXO32Q969P5 355 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 OPALINQ96PE5 141 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 CACNA1CQ13936 2221 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR5K4A6NMS3 321 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 TMEM250H0YL14 139 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 CPLX1O14810 134 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPINK1P00995 79 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-561P-201ENST00000516222 PYCR1P32322 319 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 AQP4P55087 323 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 MLF1P58340 268 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 TSPEAR-AS2P59090 65 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-561P-201ENST00000516222 PRAMEF20Q5VT98 475 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM228AQ86W67 206 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-561P-201ENST00000516222 PIH1D2Q8WWB5 315 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-561P-201ENST00000516222 CHP1Q99653 195 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-561P-201ENST00000516222 NINLQ9Y2I6 1382 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-561P-201ENST00000516222 RBFOX3A6NFN3 312 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 GOLGA6L10A6NI86 522 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 PHYHO14832 338 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 MPZL2O60487 215 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 IGHV1-69P01742 117 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 DESP17661 470 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-561P-201ENST00000516222 RAD51Q06609 339 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 EPGNQ6UW88 154 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-561P-201ENST00000516222 OR51Q1Q8NH59 317 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 DTD1Q8TEA8 209 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 ASB13Q8WXK3 278 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-561P-201ENST00000516222 C11orf49Q9H6J7 331 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 TIMM9Q9Y5J7 89 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 GMEB1Q9Y692 573 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 DSCAML1Q8TD84 2053 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-561P-201ENST00000516222 OR11H12B2RN74 326 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 C19orf84I3L1E1 186 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 M0R1B8 84 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 SLC17A3O00476 420 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 TXNDC9O14530 226 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 GATCO43716 136 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 RAB2AP61019 212 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-561P-201ENST00000516222 PDGFRLQ15198 375 aa-0.8□□□□□ -2.54
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