RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TMEM30BQ3MIR4 351 aa13.24□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 GAPTQ8N292 157 aa13.24□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 OR5M8Q8NGP6 311 aa13.24□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 CYGBQ8WWM9 190 aa13.24□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 CYYR1Q96J86 154 aa13.24□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SELENOIQ9C0D9 397 aa13.24□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 IGHG4P01861 327 aa13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 MGMTP16455 207 aa13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 LSAMPQ13449 338 aa13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 MED21Q13503 144 aa13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 STEAP3Q658P3 488 aa13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 GGHQ92820 318 aa13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 KCTD7Q96MP8 289 aa13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 TAF9BQ9HBM6 251 aa13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 OR2S2Q9NQN1 319 aa13.23□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 UBE2QL1A1L167 161 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 LANCL1O43813 399 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 CA11O75493 328 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SC5DO75845 299 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 IGF1P05019 195 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 FUT3P21217 361 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 MYF6P23409 242 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 ST3GAL4Q11206 333 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 LRRC36Q1X8D7 754 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 MORN2Q502X0 79 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 C9orf66Q5T8R8 295 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SIGIRRQ6IA17 410 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 CDH26Q8IXH8 852 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 OR52L2PQ8NGH6 319 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 C4orf3Q8WVX3 66 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 DERL3Q96Q80 235 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 PRR25Q96S07 402 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13.22□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 FAM90A10PA6NDY2 464 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 FAM90A7PA6NKC0 464 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SEC14L6B5MCN3 397 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 PSMB8P28062 276 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 CAPGP40121 348 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 GNMTQ14749 295 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 MMDQ15546 238 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 TTC23Q5W5X9 447 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 LYPD6Q86Y78 171 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SETD9Q8NE22 299 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 RITA1Q96K30 269 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 Q96M66 194 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 SCOCQ9UIL1 159 aa13.21□□□□□ -0.29
HERC3-211ENST00000513325 ZNF580Q9UK33 172 aa13.21□□□□□ -0.29
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HERC3-211ENST00000513325 CELP19835 753 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ECI1P42126 302 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R43P59537 309 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 FHL3Q13643 280 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 DOC2BQ14184 412 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 OR11H1Q8NG94 326 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 FAM46BQ96A09 425 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 KLK15Q9H2R5 256 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 KCNIP1Q9NZI2 227 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 WSB1Q9Y6I7 421 aa13.2□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 EFCAB10A6NFE3 127 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 G3V318 75 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 CNTFRP26992 372 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ACTBP60709 375 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 DHRSXQ8N5I4 330 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 NKAIN3Q8N8D7 197 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 MYOZ3Q8TDC0 251 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 NABP2Q9BQ15 211 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 JPT1Q9UK76 154 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 U3KQK5 164 aa13.19□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 PDCD6O75340 191 aa13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 PPIFP30405 207 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ZNF260Q3ZCT1 412 aa13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 NKAPLQ5M9Q1 402 aa13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 TMEM65Q6PI78 240 aa13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ZNF554Q86TJ5 538 aa13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ZNF251Q9BRH9 671 aa13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 UQCC2Q9BRT2 126 aa13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 OR51J1Q9H342 316 aa13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 GNB4Q9HAV0 340 aa13.18□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 EBAG9O00559 213 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 MYL12BO14950 172 aa13.17□□□□□ -0.3
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