RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	ARHGDIB	P52566	201 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SSX2	Q16385	188 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM219	Q86XT9	240 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	YIPF6	Q96EC8	236 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	MMP28	Q9H239	520 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	LEUTX	A8MZ59	168 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	F2RL2	O00254	374 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SOCS1	O15524	211 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	AIRE	O43918	545 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	MXD1	Q05195	221 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	PTX4	Q96A99	478 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148		J3QR06	171 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	FBXO24	O75426	580 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	GNG10	P50151	68 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	DYNLT3	P51808	116 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148		Q3ZCU0	254 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	CYYR1	Q96J86	154 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148		A0A0B4J203	849 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM127	O75204	238 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	NAPSA	O96009	420 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	HBZ	P02008	142 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SCAND1	P57086	179 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	LOXL3	P58215	753 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	UBALD1	Q8TB05	177 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	LEAP2	Q969E1	77 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	RAB3C	Q96E17	227 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	PECR	Q9BY49	303 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	GNG12	Q9UBI6	72 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	AK3	Q9UIJ7	227 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-7	P01780	117 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM50B	P56557	158 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	HMGN3	Q15651	99 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	UTF1	Q5T230	341 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SETD6	Q8TBK2	473 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	RPE	Q96AT9	228 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.28	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	SCGN	O76038	276 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	BRS3	P32247	399 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	MNDA	P41218	407 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	BLCAP	P62952	87 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.27	□□□□□ -0.29
MIB2-223	ENST00000508148	OR1L1	Q8NH94	360 aa		13.27	□□□□□ -0.29

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