RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.9□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.9□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 PCYOX1Q9UHG3 505 aa5.9□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 VAX2Q9UIW0 290 aa5.9□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.9□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PDCD4-211ENST00000498367 CACNA1SQ13698 1873 aa5.9□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 KDM5DQ9BY66 1539 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 FAM183AA6NL82 134 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 IGHMP01871 453 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ATP5G1P05496 136 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 CRYBA1P05813 215 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 FGF6P10767 208 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 IL7P13232 177 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-EP13747 358 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 CD38P28907 300 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 CTRLP40313 264 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 PSMB2P49721 201 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 CTBP2P56545 445 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF404Q494X3 552 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 RASL11AQ6T310 242 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 LRP11Q86VZ4 500 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 OR11G2Q8NGC1 345 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 PP6455Q8WZ26 134 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 MED31Q9Y3C7 131 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 DISP2A7MBM2 1401 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 DAPK1P53355 1430 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ADGRL2O95490 1459 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 MBD5Q9P267 1494 aa5.89□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF724A8MTY0 619 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 C1QL1O75973 258 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 DPM2O94777 84 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 KCNK2O95069 426 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 AIFM1O95831 613 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 GYPCP04921 128 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 GPX1P07203 203 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 MYCNOSP40205 109 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 CXCL12P48061 93 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 RPS24P62847 133 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 GSG1Q2KHT4 349 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 PYY3Q5JQD4 70 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 FRZBQ92765 325 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 IP6K3Q96PC2 410 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 GINS4Q9BRT9 223 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM45AQ9NWC5 275 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 RNF7Q9UBF6 113 aa5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 A0A0G2JN53 185 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 KNCNA6PVL3 124 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 NCR1O76036 304 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 NTN1O95631 604 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 H2AFZP0C0S5 128 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 NTF3P20783 257 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 PRTN3P24158 256 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 IMPA1P29218 277 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-DRB3P79483 266 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 IFITM3Q01628 133 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 MMDQ15546 238 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 RFESDQ8TAC1 157 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM174Q8WUU8 243 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 AP1S3Q96PC3 154 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 TSPAN32Q96QS1 320 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.87□□□□□ -1.47
PDCD4-211ENST00000498367 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms