RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	ARID1A	O14497	2285 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ROS1	P08922	2347 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293		A0A0B4J203	849 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293		A0A0B4J293	547 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	LINC00862	A6NCI5	91 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OOEP	A6NGQ2	149 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ACOD1	A6NK06	481 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293		F5H5P2	479 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SULT1C2	O00338	296 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CD5L	O43866	347 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	GMDS	O60547	372 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SC5D	O75845	299 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	RGS11	O94810	467 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	NDUFB6	O95139	128 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	LY6G6D	O95868	133 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	IFNA6	P05013	189 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ALDOB	P05062	364 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CD55	P08174	381 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	LYNX1	P0DP58	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SLC2A1	P11166	492 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	VPREB1	P12018	145 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	HNF1A	P20823	631 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CDK2	P24941	298 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	VEGFC	P49767	419 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	RIPPLY3	P57055	190 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TAS2R19	P59542	299 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	MEF2D	Q14814	521 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR8G1	Q15617	311 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	GRK1	Q15835	563 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	VWC2	Q2TAL6	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CLLU1	Q5K131	121 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	LIPN	Q5VXI9	398 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	WDR73	Q6P4I2	378 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SSX6	Q7RTT6	188 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	NAA40	Q86UY6	237 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	COMMD2	Q86X83	199 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SPIC	Q8N5J4	248 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	BEST4	Q8NFU0	473 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OR8S1	Q8NH09	359 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ST7L	Q8TDW4	575 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ERGIC1	Q969X5	290 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	RAB39B	Q96DA2	213 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	REEP6	Q96HR9	211 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SMR3A	Q99954	134 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF649	Q9BS31	505 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SPX	Q9BT56	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	IFT46	Q9NQC8	304 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	KIF25	Q9UIL4	384 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	USF3	Q68DE3	2245 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ITPR3	Q14573	2671 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293		A0A0A6YYH2	397 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293		A6NJ64	397 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	CD300LB	A8K4G0	201 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	LEUTX	A8MZ59	168 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293		B4DSR2	109 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	GOSR2	O14653	212 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	LMX1B	O60663	402 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	RAB3D	O95716	219 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-240	ENST00000495293	TGFA	P01135	160 aa		3.74	□□□□□ -1.81

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