RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 LIN7BQ9HAP6 207 aa6□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 GNG12Q9UBI6 72 aa6□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 NOTCH1P46531 2555 aa6□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 A0A0B4J203 849 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 M0QZ24 198 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 PDCD5O14737 125 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 WIPF1O43516 503 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 OR2F2O95006 317 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 IGKV1D-33P01593 117 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 IGKV1-33P01594 117 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 AMY1AP04745 511 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 AMY2AP04746 511 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 FAM106CPP0CH98 169 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 VEGFCP49767 419 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 RAB7AP51149 207 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 PSMD7P51665 324 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 TMEM50BP56557 158 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 HNF4GQ14541 408 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 C11orf88Q6PI97 169 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 Q6ZTK2 550 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 MOB3BQ86TA1 216 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 OR8H3Q8N146 312 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 FAM89BQ8N5H3 189 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 LINC00311Q8N616 119 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 DTX3Q8N9I9 347 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 CT45A3Q8NHU0 189 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 FCGR1BQ92637 280 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 AKR1E2Q96JD6 320 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 RAB9BQ9NP90 201 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 AK3Q9UIJ7 227 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.99□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 IFITM5A6NNB3 132 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 LDLRAD4O15165 306 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 PEX14O75381 377 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 TSPAN15O95858 294 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 NAPSAO96009 420 aa5.98□□□□□ -1.45
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PATJ-211ENST00000493967 CD28P10747 220 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 TMEM11P17152 192 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 RAB3BP20337 219 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 GALP22466 123 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 IL3RAP26951 378 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 HES1Q14469 280 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 HMGN3Q15651 99 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 NEDD8Q15843 81 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 MOGAT2Q3SYC2 334 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 Q3ZCU0 254 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 MORN2Q502X0 79 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
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PATJ-211ENST00000493967 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 GALMQ96C23 342 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 PECRQ9BY49 303 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 OR51E2Q9H255 320 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 RNF167Q9H6Y7 350 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 RAB22AQ9UL26 194 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 HSF4Q9ULV5 492 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 STUB1Q9UNE7 303 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.98□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 YPEL1O60688 119 aa5.97□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 FBXO24O75426 580 aa5.97□□□□□ -1.45
PATJ-211ENST00000493967 GADD45AP24522 165 aa5.97□□□□□ -1.45
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