RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492170.1

MRPL55-231, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 5

Gene MRPL55, Length 241 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-231	ENST00000492170	C15orf65	H3BRN8	121 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	AIP	O00170	330 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	ORC5	O43913	435 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	GTF2F2	P13984	249 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	GPR12	P47775	334 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	CDH26	Q8IXH8	852 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	CCDC107	Q8WV48	283 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	B9D2	Q9BPU9	175 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	TMED9	Q9BVK6	235 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	ABCG5	Q9H222	651 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	RAB9B	Q9NP90	201 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170		A0A1W2PPK0	400 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	UCHL1	P09936	223 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	HSMCR30	P0CW71	290 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	CD1B	P29016	333 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	RAB25	P57735	213 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	GPR176	Q14439	515 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	TRAM1	Q15629	374 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170		Q3ZCU0	254 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SPART	Q8N0X7	666 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SVOP	Q8N4V2	548 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170		Q8N6K4	173 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170		Q8N9W7	124 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	UBALD1	Q8TB05	177 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	PHYHIP	Q92561	330 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	LRRC42	Q9Y546	428 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	LINC01548	A6NM66	108 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	CCL24	O00175	119 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	TXNL1	O43396	289 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	MOS	P00540	346 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	MT-ND4	P03905	459 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	CD37	P11049	281 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	DGCR2	P98153	550 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SSX1	Q16384	188 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	TMEM104	Q8NE00	496 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	RAX2	Q96IS3	184 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	DUX3	Q96PT4	197 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170		A0A1W2PP11	408 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SPINT2	O43291	252 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	MAS1	P04201	325 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	FOXE3	Q13461	319 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	C6orf183	Q5T699	404 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF773	Q6PK81	442 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	OR8U1	Q8NH10	309 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	FCGR1B	Q92637	280 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	TMEM203	Q969S6	136 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	S1PR3	Q99500	378 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	ETAA1	Q9NY74	926 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	GNG12	Q9UBI6	72 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	C12orf77	C9JDV5	145 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC31A2	O15432	143 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	RAMP3	O60896	148 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	ELANE	P08246	267 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	VDAC1	P21796	283 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF137P	P52743	207 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	FABP5	Q01469	135 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SRM	P19623	302 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	SOX6	P35712	828 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	KIR2DS1	Q14954	304 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRPL55-231	ENST00000492170	DEFB136	Q30KP8	78 aa		12.03	□□□□□ -0.48

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