RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 GOSR1O95249 250 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 SERPINE2P07093 398 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 BMI1P35226 326 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 GPM6AP51674 278 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.74□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PR80 420 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF737O75373 536 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV3-9P01782 118 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 GALR1P47211 349 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM61Q5EBN2 209 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 WDR73Q6P4I2 378 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZS49 121 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 RAB24Q969Q5 203 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 RAB40CQ96S21 281 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 PSENENQ9NZ42 101 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 NAT8Q9UHE5 227 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 PRSS50Q9UI38 385 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV1D-33P01593 117 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV1-33P01594 117 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV1-39P01597 117 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV1D-39P04432 117 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 OR4A8P0C604 315 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 TESK1Q15569 626 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 PCSK4Q6UW60 755 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 AAED1Q7RTV5 226 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 IL22RA2Q969J5 263 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 FAM122AQ96E09 287 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 P2RX4Q99571 388 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 FOXB1Q99853 325 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 RARRES3Q9UL19 164 aa8.73□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PPQ1 181 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 VSTM5A8MXK1 200 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 PPP5D1E7EU14 171 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 SYNGR2O43760 224 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 CCL2P13500 99 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 CCNOP22674 350 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 PMS2P11Q13670 270 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 PCOLCEQ15113 449 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 LHX4Q969G2 390 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF488Q96MN9 340 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 OR4C12Q96R67 309 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 FUT9Q9Y231 359 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 A0A0G2JMM0 328 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PPB8 328 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PRS3 328 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 A8MXE2 369 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 H7BYZ3 331 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 NDUFS8O00217 210 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 CEACAM6P40199 344 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 KIR2DS4P43632 304 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 FGF12P61328 243 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 GNB2P62879 340 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 PRDX4Q13162 271 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 KIR2DS1Q14954 304 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 BSXQ3C1V8 233 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 GUSBP11Q6P575 273 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 CPT1CQ8TCG5 803 aa8.72□□□□□ -1.01
VWA3B-217ENST00000489630 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms