RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 IGHV2-70P01814 119 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 ZFP69Q49AA0 526 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 TIMD4Q96H15 378 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 CALYQ9NYX4 217 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 GPR31O00270 319 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 LIN54Q6MZP7 749 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 CMTM1Q8IZ96 169 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 FGFRL1Q8N441 504 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 COQ8AQ8NI60 647 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 CCL28Q9NRJ3 127 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 hADV38S2A0JD32 116 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 DVL1O14640 695 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 HSD17B6O14756 317 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 C2orf68Q2NKX9 166 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 KCTD9Q7L273 389 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 RAB1CQ92928 201 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 TOLLIPQ9H0E2 274 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 NAA60Q9H7X0 242 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 CTSZQ9UBR2 303 aa22.22■■□□□ 1.15
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HOXB3-210ENST00000489475 CGB7P0DN87 165 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 S100GP29377 79 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 GNMTQ14749 295 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 AVPI1Q5T686 147 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 CORO2AQ92828 525 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-210ENST00000489475 CHIAQ9BZP6 476 aa22.21■■□□□ 1.15
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HOXB3-210ENST00000489475 A0A0B4J2A0 478 aa22.2■■□□□ 1.14
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HOXB3-210ENST00000489475 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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HOXB3-210ENST00000489475 RPL31P62899 125 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 LDLRAD3Q86YD5 345 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 OR8U1Q8NH10 309 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 CLN8Q9UBY8 286 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 SHPKQ9UHJ6 478 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 F2RL2O00254 374 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 LTC4SQ16873 150 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 GNG12Q9UBI6 72 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 JPT1Q9UK76 154 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 LINC00312Q9Y6C7 94 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 MPPED1O15442 326 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 FCN3O75636 299 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXB3-210ENST00000489475 IGHV3-43DP0DP04 118 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXB3-210ENST00000489475 C17orf58Q2M2W7 97 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD55Q3KP44 614 aa22.19■■□□□ 1.14
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HOXB3-210ENST00000489475 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 KCNS2Q9ULS6 477 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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HOXB3-210ENST00000489475 A1L4Q6 167 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 OR2A4O95047 310 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 SIX6O95475 246 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 CLDN1O95832 211 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 H2BFSP57053 126 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM33P57088 247 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 BVESQ8NE79 360 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 OR2A7Q96R45 310 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 DSCAML1Q8TD84 2053 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 SUCNR1Q9BXA5 334 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 C19orf12Q9NSK7 152 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 PRR13Q9NZ81 148 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 USF3Q68DE3 2245 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 DBX1A6NMT0 343 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 OVOL3O00110 214 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 OR5AC1P0C628 307 aa22.17■■□□□ 1.14
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HOXB3-210ENST00000489475 OMGP23515 440 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 RAP2BP61225 183 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 TBC1D26Q86UD7 250 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 OR5M8Q8NGP6 311 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 AKR1E2Q96JD6 320 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 TAS2R3Q9NYW6 316 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 DCHS2Q6V1P9 2916 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 SMLR1H3BR10 107 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 NDUFS7O75251 213 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 C1QBP02746 253 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM155Q4W5P6 130 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 DCAF12L2Q5VW00 463 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB3-210ENST00000489475 EDARADDQ8WWZ3 215 aa22.16■■□□□ 1.14
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