RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 FOXL1Q12952 345 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 MORN2Q502X0 79 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 Q9N2K0 584 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 GNG12Q9UBI6 72 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 A0A1W2PPI3 338 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 NDUFA7O95182 113 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 SCTP09683 121 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 ALDH3B2P48448 385 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 DYNLT3P51808 116 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP10-3P60369 221 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 Q6ZS46 218 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 LINC00311Q8N616 119 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 C3orf56Q8N813 242 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 LINC01006Q8NI28 216 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 TOMM40LQ969M1 308 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 PTX4Q96A99 478 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 RPEQ96AT9 228 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 TIMM23O14925 209 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 CEACAM3P40198 252 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 SERPINB10P48595 397 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 HTD2P86397 168 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 MADCAM1Q13477 382 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 CDNFQ49AH0 187 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 GPR107Q5VW38 600 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 DRAM1Q8N682 238 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 DTX3Q8N9I9 347 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 OR56B4Q8NH76 319 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 CFHR4Q92496 578 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 GALMQ96C23 342 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 OR1A1Q9P1Q5 309 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 STAB1Q9NY15 2570 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-210ENST00000488157 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 HAX1O00165 279 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 HSD17B6O14756 317 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 TSPAN9O75954 239 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 FCGR3AP08637 254 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 CD3GP09693 182 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 RANBP1P43487 201 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 BLCAPP62952 87 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 HLA-DRB3P79483 266 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 CTF1Q16619 201 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 ZNF554Q86TJ5 538 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 ODF3L1Q8IXM7 274 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 OR4F5Q8NH21 305 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 BEX1Q9HBH7 125 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 JPT1Q9UK76 154 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.71□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 OOSP1A8MZH6 123 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 TRDCB7Z8K6 153 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 ST8SIA5O15466 376 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 YPEL1O60688 119 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 GSTT2P0CG29 244 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 GSTT2BP0CG30 244 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 PTHLHP12272 177 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 BRS3P32247 399 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 ARFRP1Q13795 201 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 HERPUD1Q15011 391 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 MOB3BQ86TA1 216 aa9.7□□□□□ -0.86
NISCH-210ENST00000488157 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms