RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ZNF134P52741 427 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 HMGN3Q15651 99 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 PLAC9Q5JTB6 97 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZTK2 550 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 OR56B1Q8NGI3 324 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 OR10V1Q8NGI7 309 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 KCTD7Q96MP8 289 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 PECRQ9BY49 303 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 ZNF702PQ9H963 129 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 GNG12Q9UBI6 72 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPI3 338 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 CT45A1Q5HYN5 189 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 OR52L2PQ8NGH6 319 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 CT45A3Q8NHU0 189 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 CFHR4Q92496 578 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 CITED1Q99966 193 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 OR2S2Q9NQN1 319 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 TIMM23O14925 209 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 RAB6AP20340 208 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 SDC2P34741 201 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 RAB7AP51149 207 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 HTD2P86397 168 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 MOGAT2Q3SYC2 334 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 MORN2Q502X0 79 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 THNSL2Q86YJ6 484 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 Q8N2B8 174 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 SGMS2Q8NHU3 365 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 PTX4Q96A99 478 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
ACTB-211ENST00000480301 TRIM64CA6NLI5 447 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B6O14756 317 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 CLEC2LP0C7M8 214 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 BLCAPP62952 87 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 GNMTQ14749 295 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZS46 218 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 C16orf82Q7Z2V1 217 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 OR8H3Q8N146 312 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 DRAM1Q8N682 238 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 OR2T6Q8NHC8 308 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 CENPOQ9BU64 300 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 JPT1Q9UK76 154 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 KCNK7Q9Y2U2 307 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 RAB27BO00194 218 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 OR2F2O95006 317 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 STEAP3Q658P3 488 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 SFXN4Q6P4A7 337 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 MOB1BQ7L9L4 216 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 OR10R2Q8NGX6 335 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 OR56B4Q8NH76 319 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 SETD6Q8TBK2 473 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 CAPSLQ8WWF8 208 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 GALMQ96C23 342 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 YIPF6Q96EC8 236 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 YPEL1O60688 119 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 FAM106CPP0CH98 169 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 REG1BP48304 166 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 ZNF137PP52743 207 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 MXD1Q05195 221 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 LY6G6FQ5SQ64 297 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 DTX3Q8N9I9 347 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 RAB3CQ96E17 227 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 YPEL2Q96QA6 119 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A33Q9BSK2 321 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 PRSS22Q9GZN4 317 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 Q9N2K0 584 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 VCX3AQ9NNX9 186 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 C12orf4Q9NQ89 552 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 SERTAD4Q9NUC0 356 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 ABRACLQ9P1F3 81 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 DAPK2Q9UIK4 370 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 IL3RAP26951 378 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 C11orf88Q6PI97 169 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 METTL21EPA6NDL7 271 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 MFNGO00587 321 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 MOB3BQ86TA1 216 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 IL1F10Q8WWZ1 152 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 AKR1E2Q96JD6 320 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 ATG5Q9H1Y0 275 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 MGAT4AQ9UM21 535 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 RGS11O94810 467 aa16.71■□□□□ 0.27
ACTB-211ENST00000480301 AMY1AP04745 511 aa16.71■□□□□ 0.27
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