RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PRM7 423 aa14.95□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGKV1D-16P01601 117 aa14.95□□□□□ -0.02
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC35B1P78383 322 aa14.93□□□□□ -0.02
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NMUP48645 174 aa14.93□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.93□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.93□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CA2P00918 260 aa14.93□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.93□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.93□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HARBI1Q96MB7 349 aa14.93□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR51M1Q9H341 326 aa14.93□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PARP14Q460N5 1801 aa14.93□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL3P10147 92 aa14.92□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LGALS7P47929 136 aa14.92□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.92□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.92□□□□□ -0.02
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