RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 ETAA1Q9NY74 926 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 A3GALT2U3KPV4 340 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ORC5O43913 435 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SOX15O60248 233 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SAP30O75446 220 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 CIB2O75838 187 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 IGF1P05019 195 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 CHATP28329 748 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 BDKRB2P30411 391 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ACTBP60709 375 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 PPP3R1P63098 170 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF616Q08AN1 781 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RAB12Q6IQ22 244 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 TMEM65Q6PI78 240 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ARPC1AQ92747 370 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GON7Q9BXV9 100 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 IL36GQ9NZH8 169 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 VSIG4Q9Y279 399 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OVOL1O14753 267 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SPINT2O43291 252 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-11P01762 117 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF137PP52743 207 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RAB40BQ12829 278 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 DOC2BQ14184 412 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ECSCRQ19T08 205 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 STX19Q8N4C7 294 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 S100A13Q99584 98 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR51J1Q9H342 316 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GAB2Q9UQC2 676 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.67□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 A0A087WW49 117 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SNTNA6NMZ2 147 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 FCN1O00602 326 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 LANCL1O43813 399 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 IGLV1-40P01703 118 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 CD2P06729 351 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR8U8P0C7N1 319 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 LYL1P12980 280 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GTF2F2P13984 249 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RAB9AP51151 201 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.021e-9■□□□□ 9
ACTB-209ENST00000473257 RIPK1Q13546 671 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MPV17LQ2QL34 196 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 KLHL22Q53GT1 634 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GHSRQ92847 366 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 FAM46BQ96A09 425 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 NABP2Q9BQ15 211 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OGG1O15527 345 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 BAG2O95816 211 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MORN2Q502X0 79 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 FAM131AQ6UXB0 335 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 LINC00596Q86U02 117 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MS4A10Q96PG2 267 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR14A2Q96R54 314 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 CLCC1Q96S66 551 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 KCNK15Q9H427 330 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 FBXL15Q9H469 300 aa8.65□□□□□ -1.02
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