RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	LGI3	Q8N145	548 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	BVES	Q8NE79	360 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TP53RK	Q96S44	253 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	NMES1	Q9C002	83 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		10.23	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TMPRSS2	O15393	492 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFSF12	O43508	249 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	IFNA21	P01568	189 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	SRPX	P78539	464 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	IFITM2	Q01629	132 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	LTC4S	Q16873	150 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	CR1L	Q2VPA4	569 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	HFE	Q30201	348 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	LRTM2	Q8N967	370 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	JPT1	Q9UK76	154 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	MPTX1	A8MV57	137 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435		H0Y980	276 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	ARPC5	O15511	151 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	OR8U9	P0C7N5	309 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	IGFBP2	P18065	325 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	GZMH	P20718	246 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	HTD2	P86397	168 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TCF23	Q7RTU1	214 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	FGFRL1	Q8N441	504 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	RFESD	Q8TAC1	157 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	OR10C1	Q96KK4	312 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	C2orf50	Q96LR7	162 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	GPHA2	Q96T91	129 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2D2	Q9H210	308 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB9B	Q9NP90	201 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	CALY	Q9NYX4	217 aa		10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
HDLBP-231	ENST00000467435	HMSD	A8MTL9	139 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435		L7N2F9	121 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	F2RL2	O00254	374 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAM20	O43506	726 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	TSC22D2	O75157	780 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	SOD3	P08294	240 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	NDUFB7	P17568	137 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	CXCL2	P19875	107 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	DRAM1	Q8N682	238 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	OR51H1	Q8NH63	302 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	GNG12	Q9UBI6	72 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PPR1	153 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	hADV38S2	A0JD32	116 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	NDUFB3	O43676	98 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	B3GALNT1	O75752	331 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	MPC2	O95563	127 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	WNT2	P09544	360 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	DANCR	P0C864	163 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	CGB3	P0DN86	165 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	CGB7	P0DN87	165 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	LYNX1	P0DP58	116 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A4	P12235	298 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	F2R	P25116	425 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	UCP1	P25874	307 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	SSTR2	P30874	369 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	MSMO1	Q15800	293 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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