RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM268Q5VZI3 342 aa15.63■□□□□ 0.09
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CAPN3-209ENST00000466222 DCAF16Q9NXF7 216 aa15.63■□□□□ 0.09
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CAPN3-209ENST00000466222 FAM90A12PA8MX19 464 aa15.6■□□□□ 0.09
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CAPN3-209ENST00000466222 FAM90A14PP0C7W9 464 aa15.6■□□□□ 0.09
CAPN3-209ENST00000466222 FAM90A24PP0C7X0 464 aa15.6■□□□□ 0.09
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CAPN3-209ENST00000466222 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CAPN3-209ENST00000466222 FAM221AA4D161 298 aa15.58■□□□□ 0.09
CAPN3-209ENST00000466222 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
CAPN3-209ENST00000466222 HS3ST1O14792 307 aa15.58■□□□□ 0.09
CAPN3-209ENST00000466222 NDUFA2O43678 99 aa15.58■□□□□ 0.09
CAPN3-209ENST00000466222 HEXAP06865 529 aa15.58■□□□□ 0.09
CAPN3-209ENST00000466222 MZT1Q08AG7 82 aa15.58■□□□□ 0.09
CAPN3-209ENST00000466222 LIAT1Q6ZQX7 453 aa15.58■□□□□ 0.09
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