RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 TGFBR3Q03167 851 aa15.53■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TESK1Q15569 626 aa15.53■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 HES3Q5TGS1 186 aa15.53■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 DPPA3Q6W0C5 159 aa15.53■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PR64 198 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PR80 420 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PRV1 198 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CDIPTO14735 213 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SMPD2O60906 423 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 WDR1O75083 606 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CELA3BP08861 270 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 MEOX2P50222 304 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 WDR86Q86TI4 376 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 FRYQ5TBA9 3013 aa15.52■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SH2D1BO14796 132 aa15.52■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 WNT2P09544 360 aa15.52■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 AGAP20933 346 aa15.52■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM178AQ8NBL3 297 aa15.52■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 UBALD1Q8TB05 177 aa15.52■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 NCOR1O75376 2440 aa15.52■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ESPL1Q14674 2120 aa15.52■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 SYNGR2O43760 224 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 IGLV2-14P01704 120 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 RNFT1Q5M7Z0 435 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ADAM5Q6NVV9 412 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 Q6ZRM9 215 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 OR2C1O95371 312 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1-39P01597 117 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1D-39P04432 117 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 IAPPP10997 89 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ERVK11-1P61568 191 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 PLA2G2CQ5R387 149 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 LOXL4Q96JB6 756 aa15.51■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 H3BQ15 152 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 PGA5P0DJD9 388 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 CEACAM6P40199 344 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ERVS71-1P61550 626 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 PSENENQ9NZ42 101 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 OR14J1Q9UGF5 321 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 C5orf52A6NGY3 159 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 GRPP07492 148 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 SRP19P09132 144 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF146Q15072 292 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa15.5■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 LYZL6O75951 148 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 RAC2P15153 192 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 CD200P41217 278 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ICAM4Q14773 271 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF506Q5JVG8 444 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A40Q8TBP6 338 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1-5P01602 117 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 METTL15P1P0C7V9 234 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 OR2B8PP59922 312 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2KP61086 200 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 HBG1P69891 147 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 HBG2P69892 147 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 LILRB2Q8N423 598 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 CLDND2Q8NHS1 167 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 MED12LQ86YW9 2145 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 RNF212BA8MTL3 300 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 M0R296 226 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2CO00762 179 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 CBR1P16152 277 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 IGHV1-2P23083 117 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF429Q86V71 674 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 RAB39BQ96DA2 213 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 RSG1Q9BU20 258 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM9BQ9NQ34 198 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 WIPI2Q9Y4P8 454 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 SELEP16581 610 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF585BQ52M93 769 aa15.48■□□□□ 0.07
SYNE4-204ENST00000465425 OBP2BQ9NPH6 170 aa15.48■□□□□ 0.07
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