RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464475.1

CREM-222, Transcript of cAMP responsive element modulator, human

TSL 5

Gene CREM, Length 453 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREM-222	ENST00000464475	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	SPDEF	O95238	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	MYL12A	P19105	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	SLC6A1	P30531	599 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	FMO3	P31513	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	GPR12	P47775	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	OMP	P47874	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	OR12D2	P58182	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	SST	P61278	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	DGCR6	Q14129	220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	GAMT	Q14353	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	ZNF79	Q15937	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	MICA	Q29983	383 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	RNF183	Q96D59	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	COPS4	Q9BT78	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREM-222	ENST00000464475	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	TVP23A	A6NH52	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	RGS5	O15539	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	ORC5	O43913	435 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	SCO1	O75880	301 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	REN	P00797	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	CST4	P01036	141 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	APOC1	P02654	83 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	RBP4	P02753	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	ZNF823	P16415	610 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	C4BPB	P20851	252 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	CD24	P25063	80 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	ACKR3	P25106	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	TGFBR1	P36897	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	HAAO	P46952	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	RORC	P51449	518 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	RAB14	P61106	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	PRDX4	Q13162	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475		Q6ZSN1	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	OR2T27	Q8NH04	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	TXN2	Q99757	166 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	OR51I2	Q9H344	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CREM-222	ENST00000464475	FN3K	Q9H479	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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