RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB12Q6IQ22 244 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEX38Q6PEX7 206 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEK7Q8TDX7 302 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM80Q96HE8 168 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 DERL3Q96Q80 235 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 BANF2Q9H503 90 aa6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GAPDHP28-201ENST00000455134 LYSTQ99698 3801 aa6.59□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 TXNL1O43396 289 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 LANCL1O43813 399 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAS1P04201 325 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNAO1P09471 354 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 DGCR2P98153 550 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDPQ00604 133 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD69Q07108 199 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST3GAL4Q11206 333 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 AWAT2Q6E213 333 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDH26Q8IXH8 852 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 TFAP2CQ92754 450 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPF1Q92782 380 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCTD7Q96MP8 289 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR25Q96S07 402 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 NABP2Q9BQ15 211 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLK15Q9H2R5 256 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNK15Q9H427 330 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNB4Q9HAV0 340 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ETAA1Q9NY74 926 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.58□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 IRGMA1A4Y4 181 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2QL1A1L167 161 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 G3V318 75 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 I3L521 148 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP6V0E1O15342 81 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX15O60248 233 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV1-40P01703 118 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 HLA-DRB1P01911 266 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD1AP06126 327 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD37P11049 281 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYL12AP19105 171 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYF6P23409 242 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL3RAP26951 378 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHATP28329 748 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOX6P35712 828 aa6.57□□□□□ -1.36
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GAPDHP28-201ENST00000455134 HMGN3Q15651 99 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 C6orf183Q5T699 404 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 STEAP3Q658P3 488 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR10K2Q6IF99 312 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR18Q8N4B5 295 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR8U1Q8NH10 309 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYGBQ8WWM9 190 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A13Q99584 98 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNG12Q9UBI6 72 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.57□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 JPT1Q9UK76 154 aa6.57□□□□□ -1.36
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