RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR2S2Q9NQN1 319 aa17.3■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 M0QZK8 103 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SOCS1O15524 211 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LPLP06858 475 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HES1Q14469 280 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 KCTD21Q4G0X4 260 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MOB1BQ7L9L4 216 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR56B1Q8NGI3 324 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CFHR4Q92496 578 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SERTAD4Q9NUC0 356 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABRACLQ9P1F3 81 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 JPT1Q9UK76 154 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HSF4Q9ULV5 492 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 STUB1Q9UNE7 303 aa17.29■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SHISA3A0PJX4 238 aa17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IFITM5A6NNB3 132 aa17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NAPSAO96009 420 aa17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 VEGFCP49767 419 aa17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR10A3P58181 314 aa17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HTD2P86397 168 aa17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 STEAP3Q658P3 488 aa17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF439Q8NDP4 499 aa17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GALMQ96C23 342 aa17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RAB22AQ9UL26 194 aa17.28■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LDLRAD4O15165 306 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SLC31A2O15432 143 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RGS11O94810 467 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 REG1BP48304 166 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HMGN3Q15651 99 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FBLN7Q53RD9 439 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MOB3BQ86TA1 216 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SETD6Q8TBK2 473 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 AK3Q9UIJ7 227 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SSR3Q9UNL2 185 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MOB4Q9Y3A3 225 aa17.27■□□□□ 0.36
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WNK1Q9H4A3 2382 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TXNL1O43396 289 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMEM11P17152 192 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C2orf68Q2NKX9 166 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABCA11PQ4W5N1 156 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MORN2Q502X0 79 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CT45A1Q5HYN5 189 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF880Q6PDB4 577 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 Q6ZS46 218 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR52L2PQ8NGH6 319 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CT45A3Q8NHU0 189 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MGAT4AQ9UM21 535 aa17.26■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 YPEL1O60688 119 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGKV1D-33P01593 117 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGKV1-33P01594 117 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF134P52741 427 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF137PP52743 207 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMEM50BP56557 158 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GNMTQ14749 295 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 NEDD8Q15843 81 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C11orf44Q8N8P7 122 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IL1F10Q8WWZ1 152 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 YPEL2Q96QA6 119 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PECRQ9BY49 303 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C12orf4Q9NQ89 552 aa17.25■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMEM95Q3KNT9 176 aa17.24■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LY6G6FQ5SQ64 297 aa17.24■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IZUMO1Q8IYV9 350 aa17.24■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LYG1Q8N1E2 194 aa17.24■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WNT10AQ9GZT5 417 aa17.24■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MMP27Q9H306 513 aa17.24■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FBXO24O75426 580 aa17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RAB6AP20340 208 aa17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GADD45AP24522 165 aa17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PLA2G7Q13093 441 aa17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HNF4GQ14541 408 aa17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C9orf152Q5JTZ5 239 aa17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C5orf24Q7Z6I8 188 aa17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TPRA1Q86W33 373 aa17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR2AK2Q8NG84 335 aa17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR51E2Q9H255 320 aa17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms