RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZPA2 131 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 ZNF329Q86UD4 541 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 LINC00311Q8N616 119 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 CT45A3Q8NHU0 189 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 PHYHIPQ92561 330 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 TMEM59Q9BXS4 323 aa10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 LINC01548A6NM66 108 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 UBBP0CG47 229 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 CLDN12P56749 244 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 TPBGQ13641 420 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 OR4F17Q8NGA8 305 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 OR4X2Q8NGF9 303 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 NEDD4LQ96PU5 975 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 OR4F4Q96R69 305 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 FAAP24Q9BTP7 215 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 OR2S2Q9NQN1 319 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 GHRLQ9UBU3 117 aa10.96□□□□□ -0.65
PRAME-209ENST00000439106 TMEM14DPA8MWL7 114 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 M0QZK8 103 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SLC22A1O15245 554 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 CA11O75493 328 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 IL3RAP26951 378 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 QRFPP83859 136 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 FABP5Q01469 135 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 PRSS48Q7RTY5 328 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 IZUMO1Q8IYV9 350 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 Q8N6K4 173 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 C8orf31Q8N9H6 132 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 MGLLQ99685 303 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 VCX3BQ9H321 246 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 PLGRKTQ9HBL7 147 aa10.95□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 PSMB11A5LHX3 300 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SOCS1O15524 211 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 FGF16O43320 207 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 GLAP06280 429 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 PF4V1P10720 104 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 CPEP16870 476 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 CALRP27797 417 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 PLA2G7Q13093 441 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 EBI3Q14213 229 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 MORN2Q502X0 79 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 TRAT1Q6PIZ9 186 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SLC35E3Q7Z769 313 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 Q8N9W7 124 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 OR6M1Q8NGM8 313 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SETD6Q8TBK2 473 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 TM2D1Q9BX74 207 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 LPAR5Q9H1C0 372 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 KCNIP1Q9NZI2 227 aa10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SERPINE3A8MV23 424 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 ATP6V1G2O95670 118 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 BPNT1O95861 308 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 PF4P02776 101 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 CD37P11049 281 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 F2RL1P55085 397 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 HMGN3Q15651 99 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SSX1Q16384 188 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 Q3ZCU0 254 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SVOPQ8N4V2 548 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 OR51D1Q8NGF3 324 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 OR2T10Q8NGZ9 312 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 IL1F10Q8WWZ1 152 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 ISYNA1Q9NPH2 558 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 JPT1Q9UK76 154 aa10.93□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SHISA3A0PJX4 238 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SLC17A2O00624 439 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 MOSP00540 346 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 IGHG2P01859 326 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 IGLL1P15814 213 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 ARSBP15848 533 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 CD33P20138 364 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 OR3A3P47888 321 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 HSPA13P48723 471 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 ZNF137PP52743 207 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 RAB11BQ15907 218 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 HES5Q5TA89 166 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.92□□□□□ -0.66
PRAME-209ENST00000439106 PHF21AQ96BD5 680 aa10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 229 ms