RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 DTYMKP23919 212 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 CXCR1P25024 350 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 MIPP30301 263 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 PLTPP55058 493 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 IFITM3Q01628 133 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 PRKCDQ05655 676 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 PSG7Q13046 419 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 TRAM1Q15629 374 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 CDNFQ49AH0 187 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 FAM151BQ6UXP7 276 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 ZNF429Q86V71 674 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 LGI3Q8N145 548 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 OR51Q1Q8NH59 317 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 OR5P2Q8WZ92 322 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 FAM210BQ96KR6 192 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 SNX24Q9Y343 169 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 CACNG2Q9Y698 323 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 SVILO95425 2214 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 POLEQ07864 2286 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 FABP12A6NFH5 140 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 RP2O75695 350 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 HLA-DQB2P05538 268 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 PIRTP0C851 137 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 HLA-GP17693 338 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 APLNRP35414 380 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 LHX2P50458 406 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 TFF3Q07654 80 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 GTF3C1Q12789 2109 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 NAB1Q13506 487 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 TTC32Q5I0X7 151 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 HHATQ5VTY9 493 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 SPINK14Q6IE38 97 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 PSMF1Q92530 271 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF488Q96MN9 340 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 C1orf109Q9NX04 203 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 USH1CQ9Y6N9 552 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 TAAR5O14804 337 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 PSPHP1O15172 72 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 SLC22A5O76082 557 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 SNAP29O95721 258 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 TRBV12-3P01733 135 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 PAX6P26367 422 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 RAB38P57729 211 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 CRADDP78560 199 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 PRSS8Q16651 343 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 LINC01555Q8NAE3 123 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 CDS1Q92903 461 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 FAM104AQ969W3 186 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRK-212ENST00000434424 PTX4Q96A99 478 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 ASB8Q9H765 288 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
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PTPRK-212ENST00000434424 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 KCNK1O00180 336 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 MANBAO00462 879 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CDIPTO14735 213 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 TCAPO15273 167 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 MYO1DO94832 1006 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-212ENST00000434424 S100A6P06703 90 aa4.9□□□□□ -1.63
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