RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa16.48■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 GHRLQ9UBU3 117 aa16.48■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.48■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 LANCL1O43813 399 aa16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 IGHG4P01861 327 aa16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 MAS1P04201 325 aa16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 IGF1P05019 195 aa16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 FUT3P21217 361 aa16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 WNT4P56705 351 aa16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC36Q1X8D7 754 aa16.47■□□□□ 0.23
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LIMS1-208ENST00000428064 OR8U1Q8NH10 309 aa16.47■□□□□ 0.23
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LIMS1-208ENST00000428064 RAX2Q96IS3 184 aa16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 SELENOIQ9C0D9 397 aa16.47■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 DCLRE1BQ9H816 532 aa16.47■□□□□ 0.23
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LIMS1-208ENST00000428064 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
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LIMS1-208ENST00000428064 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 CELP19835 753 aa16.46■□□□□ 0.23
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LIMS1-208ENST00000428064 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.46■□□□□ 0.23
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LIMS1-208ENST00000428064 SIGIRRQ6IA17 410 aa16.46■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 LAIR2Q6ISS4 152 aa16.46■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa16.46■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 OR10V1Q8NGI7 309 aa16.46■□□□□ 0.23
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LIMS1-208ENST00000428064 TAF9BQ9HBM6 251 aa16.46■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa16.46■□□□□ 0.23
LIMS1-208ENST00000428064 JPT1Q9UK76 154 aa16.46■□□□□ 0.23
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LIMS1-208ENST00000428064 PDCD6O75340 191 aa16.45■□□□□ 0.22
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LIMS1-208ENST00000428064 LSAMPQ13449 338 aa16.45■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DS1Q14954 304 aa16.45■□□□□ 0.22
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LIMS1-208ENST00000428064 PRR18Q8N4B5 295 aa16.45■□□□□ 0.22
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LIMS1-208ENST00000428064 CST11Q9H112 138 aa16.45■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 OR2S2Q9NQN1 319 aa16.45■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.44■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 RAMP3O60896 148 aa16.44■□□□□ 0.22
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LIMS1-208ENST00000428064 NANOGP1Q8N7R0 232 aa16.44■□□□□ 0.22
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LIMS1-208ENST00000428064 KCNIP1Q9NZI2 227 aa16.44■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 GNAO1P09471 354 aa16.43■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 UBBP0CG47 229 aa16.43■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 PSMB8P28062 276 aa16.43■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 DGCR2P98153 550 aa16.43■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 AHSA2Q719I0 299 aa16.43■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 OR5M8Q8NGP6 311 aa16.43■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 MYOZ3Q8TDC0 251 aa16.43■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf3Q8WVX3 66 aa16.43■□□□□ 0.22
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LIMS1-208ENST00000428064 LRRC42Q9Y546 428 aa16.43■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 YPEL1O60688 119 aa16.42■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 CD69Q07108 199 aa16.42■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 FHL3Q13643 280 aa16.42■□□□□ 0.22
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LIMS1-208ENST00000428064 C11orf87Q6NUJ2 197 aa16.42■□□□□ 0.22
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LIMS1-208ENST00000428064 RGS11O94810 467 aa16.41■□□□□ 0.22
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LIMS1-208ENST00000428064 RCN1Q15293 331 aa16.41■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 MMDQ15546 238 aa16.41■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.41■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 PHYHIPQ92561 330 aa16.41■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD7Q96MP8 289 aa16.41■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 ERGIC3Q9Y282 383 aa16.41■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DRB1P01911 266 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 CHATP28329 748 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 HMGN3Q15651 99 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB136Q30KP8 78 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 FAM71F2Q6NXP2 309 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 LCNL1Q6ZST4 164 aa16.4■□□□□ 0.22
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa16.4■□□□□ 0.22
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