RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427506.5

GPC1-205, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 3

Gene GPC1, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-205ENST00000427506 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CYYR1Q96J86 154 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 KCNK15Q9H427 330 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 PSMB11A5LHX3 300 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 SERPINE3A8MV23 424 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 SLC22A1O15245 554 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 TXNL1O43396 289 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ARL6IP5O75915 188 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CHATP28329 748 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 MAP2K4P45985 399 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ZNF134P52741 427 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 EBI3Q14213 229 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 MGLLQ99685 303 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 BPNT1O95861 308 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CPEP16870 476 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CD1BP29016 333 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 P2RY14Q15391 338 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 MORN2Q502X0 79 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 GALMQ96C23 342 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 NICN1Q9BSH3 213 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 MOSP00540 346 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 PF4P02776 101 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ARSBP15848 533 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CD33P20138 364 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 UNC119Q13432 240 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 GNMTQ14749 295 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 STEAP3Q658P3 488 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ZNF329Q86UD4 541 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 SETD6Q8TBK2 473 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 TM2D1Q9BX74 207 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 JPT1Q9UK76 154 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 LRRC42Q9Y546 428 aa14.6□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 SLC17A2O00624 439 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 RGS11O94810 467 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ZNF137PP52743 207 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 HTD2P86397 168 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 RAB11BQ15907 218 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 NOTCH1P46531 2555 aa14.59□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 IGHG2P01859 326 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 CD37P11049 281 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 SLC35B1P78383 322 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 QRFPP83859 136 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 FABP5Q01469 135 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 Q8N6K4 173 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 GFI1Q99684 422 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 RAB26Q9ULW5 256 aa14.58□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 LANCL1O43813 399 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 YPEL1O60688 119 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 RANBP1P43487 201 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 HMGN3Q15651 99 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 Q8N9W7 124 aa14.57□□□□□ -0.08
GPC1-205ENST00000427506 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms