RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1W2PPH5	198 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM172BP	A6NC97	362 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	OR5H14	A6NHG9	310 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964		A8MXK9	166 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	TUSC2	O75896	110 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	PPY	P01298	95 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	HEXA	P06865	529 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF728	P0DKX0	622 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	OMG	P23515	440 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	ECI1	P42126	302 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	DLX6	P56179	175 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	FXYD4	P59646	89 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	CD276	Q5ZPR3	534 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	TOMM40L	Q969M1	308 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	MOB3A	Q96BX8	217 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	RDH8	Q9NYR8	311 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	GNG12	Q9UBI6	72 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	JPT1	Q9UK76	154 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FAAP20-208	ENST00000420964	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	F8	P00451	2351 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RLN1	P04808	185 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LIPF	P07098	398 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PGAM2	P15259	253 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	CEACAM6	P40199	344 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LOXL3	P58215	753 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LCN2	P80188	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	BAMBI	Q13145	260 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		Q6ZNX1	250 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	FOXH1	O75593	365 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	MMP23A	O75900	390 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RGS11	O94810	467 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RBP4	P02753	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	NFYB	P25208	207 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	RAB25	P57735	213 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	MED13L	Q71F56	2210 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A096LNT2	108 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	C17orf98	A8MV24	154 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM157A	C9JC47	383 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	YPEL1	O60688	119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	PEX14	O75381	377 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	UCP3	P55916	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	MORN2	Q502X0	79 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		10.12	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms