RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411249.1

RNU6-1199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1199, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1199P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ACBD6Q9BR61 282 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CDCA4Q9BXL8 241 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GOLPH3Q9H4A6 298 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 AUNIPQ9H7T9 357 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SCML1Q9UN30 329 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SNURFQ9Y675 71 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 APCP25054 2843 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NEBP20929 6669 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FAM183AA6NL82 134 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PLA2G10O15496 165 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PDCD6O75340 191 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BPGMP07738 259 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FGF4P08620 206 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SPNP16150 400 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CSKP41240 450 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RPS5P46782 204 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PSMC5P62195 406 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 STX4Q12846 297 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 XRCC4Q13426 336 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IL18Q14116 193 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TAL2Q16559 108 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NDUFAF6Q330K2 333 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 EBLN2Q6P2I7 272 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GPATCH11Q8N954 259 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SUN5Q8TC36 379 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DOK4Q8TEW6 326 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MBD3L1Q8WWY6 194 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GALMQ96C23 342 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SMR3AQ99954 134 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DOHHQ9BU89 302 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IFNKQ9P0W0 207 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HHLA3Q9XRX5 114 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NUMA1Q14980 2115 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TRAV25A0A0B4J276 109 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CTAGE15A4D2H0 777 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LINC00862A6NCI5 91 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TVP23AA6NH52 213 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SUPT3HB4E1H0 165 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TMEM250H0YL14 139 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OR8G3PP0DMU2 310 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IVDP26440 423 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ATP6V0CP27449 155 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GCLMP48507 274 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TTPAP49638 278 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PDGFRLQ15198 375 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C7orf65Q6ZTY9 151 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CTAGE6Q86UF2 777 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KATNAL2Q8IYT4 538 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 Q8N2B8 174 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF439Q8NDP4 499 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OR8G5Q8NG78 346 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OR9I1Q8NGQ6 314 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DTD1Q8TEA8 209 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CERS2Q96G23 380 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MED18Q9BUE0 208 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SUCNR1Q9BXA5 334 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FBXL15Q9H469 300 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C11orf49Q9H6J7 331 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ACOT13Q9NPJ3 140 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NMRK1Q9NWW6 199 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SCN9AQ15858 1988 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HMSDA8MTL9 139 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 J3QLI3 93 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PSMD11O00231 422 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PRH1P02810 166 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 UCHL1P09936 223 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF728P0DKX0 622 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SULT1A2P50226 295 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RAB38P57729 211 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TSPEAR-AS2P59090 65 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ELOBQ15370 118 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TMEM31Q5JXX7 168 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HES3Q5TGS1 186 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RESP18Q5W5W9 173 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms