RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 HLA-DRB5Q30154 266 aa21.92■■□□□ 1.1
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GNPTAB-202ENST00000392919 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 J3QR06 171 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 IGHV3-43DP0DP04 118 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 HTR1DP28221 377 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 PRRX1P54821 245 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SSX2Q16385 188 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 TREML4Q6UXN2 200 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 Q6ZSV7 163 aa21.91■■□□□ 1.1
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GNPTAB-202ENST00000392919 C12orf4Q9NQ89 552 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 DPM3Q9P2X0 92 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 VPREB3Q9UKI3 123 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF114Q9Y508 228 aa21.91■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A075B6Q4 140 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 WIPF1O43516 503 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 GNG10P50151 68 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM30BQ3MIR4 351 aa21.9■■□□□ 1.1
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GNPTAB-202ENST00000392919 MMP28Q9H239 520 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 DCSTAMPQ9H295 470 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 Q9N2K0 584 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 SCOCQ9UIL1 159 aa21.9■■□□□ 1.1
GNPTAB-202ENST00000392919 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 AANATQ16613 207 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 SSX3Q99909 188 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 CITED1Q99966 193 aa21.89■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.093e-6■■□□□ 13.5
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GNPTAB-202ENST00000392919 LY6LH3BQJ8 138 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 SCGNO76038 276 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 CD3GP09693 182 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 CDNFQ49AH0 187 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 OR52L2PQ8NGH6 319 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 OR10V1Q8NGI7 309 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 GNG12Q9UBI6 72 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa21.88■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A1W2PPE3 182 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 BTBD17A6NE02 478 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 VGLL3A8MV65 326 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 LEUTXA8MZ59 168 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 HTD2P86397 168 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 PLA1AQ53H76 456 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 PIFOQ8TCI5 191 aa21.87■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 H3BUX3 64 aa21.86■■□□□ 1.09
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GNPTAB-202ENST00000392919 GNMTQ14749 295 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 ARL6IP1Q15041 203 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF260Q3ZCT1 412 aa21.86■■□□□ 1.09
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GNPTAB-202ENST00000392919 C8orf31Q8N9H6 132 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF439Q8NDP4 499 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 OR5R1Q8NH85 324 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 CREB3L1Q96BA8 519 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 GALMQ96C23 342 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCG5Q9H222 651 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 OR2S2Q9NQN1 319 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 JPT1Q9UK76 154 aa21.86■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC31A2O15432 143 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 FCGR3AP08637 254 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 RORCP51449 518 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 TMBIM6P55061 237 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 HLA-DRB3P79483 266 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 SPCS2Q15005 226 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 RAB2BQ8WUD1 216 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 MGAT4AQ9UM21 535 aa21.85■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNAB3O43448 404 aa21.84■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 SCTP09683 121 aa21.84■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 RAB13P51153 203 aa21.84■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF134P52741 427 aa21.84■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 ARFRP1Q13795 201 aa21.84■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 MORN2Q502X0 79 aa21.84■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 HACD4Q5VWC8 232 aa21.84■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 SAMD12Q8N8I0 201 aa21.84■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 BCL7BQ9BQE9 202 aa21.84■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 C16orf95Q9H693 158 aa21.84■■□□□ 1.09
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GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM235A6NFC5 223 aa21.83■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 A6NJ64 397 aa21.83■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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GNPTAB-202ENST00000392919 DYNLT3P51808 116 aa21.83■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 LY6EQ16553 131 aa21.83■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 CT45A1Q5HYN5 189 aa21.83■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 UBE2NLQ5JXB2 153 aa21.83■■□□□ 1.09
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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