RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372478.4

C9orf50-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene C9orf50, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50-201ENST00000372478 MOGAT2Q3SYC2 334 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 CDNFQ49AH0 187 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 OR52W1Q6IF63 320 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 OR11H6Q8NGC7 330 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 RAB3CQ96E17 227 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 JMJD8Q96S16 334 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 PRDM13Q9H4Q3 707 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 SCPEP1Q9HB40 452 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa20.5■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 RBBP9O75884 186 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 PTTG1O95997 202 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 GSTT2BP0CG30 244 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 GZMHP20718 246 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 PAX6P26367 422 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 LGALS4P56470 323 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF626Q68DY1 528 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 OR52I2Q8NH67 350 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 TRIM63Q969Q1 353 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 AJUBAQ96IF1 538 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 CLEC7AQ9BXN2 247 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 LINC00574Q9H8X3 128 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 ODF3BA8MYP8 253 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 ORC5O43913 435 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 FBP1P09467 338 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 AP3S2P59780 193 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 OXA1LQ15070 435 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF260Q3ZCT1 412 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 PLAC9Q5JTB6 97 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 MZT2BQ6NZ67 158 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 Q6YL49 198 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 Q6ZTK2 550 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 ABHD12Q8N2K0 398 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 ARL11Q969Q4 196 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 PECRQ9BY49 303 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 ZNF286AQ9HBT8 521 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 TBC1D24Q9ULP9 559 aa20.49■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 CENPXA8MT69 81 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 C15orf65H3BRN8 121 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 LANCL1O43813 399 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 MELTFP08582 738 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 CENPSQ8N2Z9 138 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 LEAP2Q969E1 77 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 TNFRSF19Q9NS68 423 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 AK3Q9UIJ7 227 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 HSF4Q9ULV5 492 aa20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 C12orf77C9JDV5 145 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 IGHV3-7P01780 117 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 C5orf24Q7Z6I8 188 aa20.47■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 PLA2G10O15496 165 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 LPLP06858 475 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 PTHLHP12272 177 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 UBA52P62987 128 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 SLC9A3R2Q15599 337 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 C6orf183Q5T699 404 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 PRR18Q8N4B5 295 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 KLK11Q9UBX7 282 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 MTFP1Q9UDX5 166 aa20.46■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 Q6ZPA2 131 aa20.45■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 GPX8Q8TED1 209 aa20.45■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 ZNRD1Q9P1U0 126 aa20.45■□□□□ 0.87
C9orf50-201ENST00000372478 LYRM1O43325 122 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 NAPSAO96009 420 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 IGHV4-59P01825 116 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 GNB3P16520 340 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 CD34P28906 385 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 ACTBP60709 375 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 ACTG1P63261 375 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 DYRK1AQ13627 763 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 LDLRAD3Q86YD5 345 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 OR1L1Q8NH94 360 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 DEDD2Q8WXF8 326 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 TAF9BQ9HBM6 251 aa20.45■□□□□ 0.86
C9orf50-201ENST00000372478 KCNK7Q9Y2U2 307 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms