RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371786.3

C9orf116-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf116, Length 612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-201ENST00000371786 JPT1Q9UK76 154 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf116-201ENST00000371786 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf116-201ENST00000371786 POLQO75417 2590 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf116-201ENST00000371786 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 A0A096LNT2 108 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 C17orf98A8MV24 154 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 FAM157AC9JC47 383 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 FOXH1O75593 365 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 MMP23AO75900 390 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 PPYP01298 95 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 LCN2P80188 198 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 MOB3AQ96BX8 217 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 RDH8Q9NYR8 311 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 GNG12Q9UBI6 72 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 OR2W1Q9Y3N9 320 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 FAM172BPA6NC97 362 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 ERVFRD-1P60508 538 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 HERV-K104P61576 105 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 PAX2Q02962 417 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 MORN2Q502X0 79 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 NUDT15Q9NV35 164 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 PDZD2O15018 2839 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 YPEL1O60688 119 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 RBP4P02753 201 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 NFYBP25208 207 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 ECI1P42126 302 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 UCP3P55916 312 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 FXYD4P59646 89 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 UPRTQ96BW1 309 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 YPEL2Q96QA6 119 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 FOXC2Q99958 501 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 GPR132Q9UNW8 380 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 VSIG4Q9Y279 399 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 HECTD1Q9ULT8 2610 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 RGS11O94810 467 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 PGAM2P15259 253 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 UTF1Q5T230 341 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 Q6ZNX1 250 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 TOMM40LQ969M1 308 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 Q96MF0 132 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 REG4Q9BYZ8 158 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 A0A1W2PPE2 198 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 A0A1W2PR64 198 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 A0A1W2PRV1 198 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 RNF223E7ERA6 249 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 M0R1W7 72 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 RLN1P04808 185 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 ARF6P62330 175 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 C1orf159Q96HA4 380 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 MMP26Q9NRE1 261 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 ITGB1BP1O14713 200 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 OR8U9P0C7N5 309 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf116-201ENST00000371786 RAG2P55895 527 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms