RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 OR11H1Q8NG94 326 aa8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 KCTD7Q96MP8 289 aa8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 SLC29A1Q99808 456 aa8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ETAA1Q9NY74 926 aa8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 SPINT2O43291 252 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 IGHG4P01861 327 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 HBZP02008 142 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 PSMB8P28062 276 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ADMP35318 185 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF134P52741 427 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 MMDQ15546 238 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 Q3ZCU0 254 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 C6orf183Q5T699 404 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 OR1L1Q8NH94 360 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 MUL1Q969V5 352 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 OR5B12Q96R08 314 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 GNB4Q9HAV0 340 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 RAB9BQ9NP90 201 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 SCOCQ9UIL1 159 aa8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1W2PPK0 400 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 OGG1O15527 345 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 LALBAP00709 142 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 IGF1P05019 195 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 OR5H8P0DN80 308 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 VHLP40337 213 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF137PP52743 207 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 LSAMPQ13449 338 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 FHL3Q13643 280 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 GPR176Q14439 515 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 GNMTQ14749 295 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 RAB12Q6IQ22 244 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM65Q6PI78 240 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 SMIM19Q96E16 107 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 CYYR1Q96J86 154 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 BANF2Q9H503 90 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 PARP11Q9NR21 331 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 CKLFQ9UBR5 152 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.06□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 UBE2QL1A1L167 161 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 G3V318 75 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ATP6V0E1O15342 81 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 LANCL1O43813 399 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 MAS1P04201 325 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 OR8U8P0C7N1 319 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 MYL12AP19105 171 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 CNTFRP26992 372 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 DCKP27707 260 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ACTBP60709 375 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 GNB1P62873 340 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 Q499Y3 187 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 MORN2Q502X0 79 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 AWAT2Q6E213 333 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 GHSRQ92847 366 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 KLK15Q9H2R5 256 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.05□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.04□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 IRGMA1A4Y4 181 aa8.04□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 C3orf84H3BNL1 204 aa8.04□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 I3L521 148 aa8.04□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 MGMTP16455 207 aa8.04□□□□□ -1.12
CLRN3-201ENST00000368671 CHATP28329 748 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms