RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 PRSS12P56730 875 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 COTL1Q14019 142 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 PARLQ9H300 379 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 LILRA1O75019 489 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 POC1BQ8TC44 478 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 GPR35Q9HC97 309 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.39□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 GCH1P30793 250 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 PLA2G5P39877 138 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 TESK1Q15569 626 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 GAPTQ8N292 157 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 LHX4Q969G2 390 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 CLDN23Q96B33 292 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 RASL10BQ96S79 203 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 TNFSF13O75888 250 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 UMODP07911 640 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 PTGDSP41222 190 aa14.38□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZFAND5O76080 213 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 IL3RAP26951 378 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 OR5T1Q8NG75 326 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 RNF150Q9ULK6 438 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 HLA-BQ31612 363 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 A0A0G2JRQ6 117 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 CFIP05156 583 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 CTSSP25774 331 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 SAP25Q8TEE9 199 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.37□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1D-12P01611 117 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 UCP1P25874 307 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 CHRNA7P36544 502 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ARL16Q0P5N6 197 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 PRDX4Q13162 271 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 KCNMB1Q16558 191 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 FAM78BQ5VT40 261 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 YPEL1O60688 119 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 GYPAP02724 150 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 RAB7AP51149 207 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 TEX43Q6ZNM6 134 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 Q6ZWC4 215 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 YPEL2Q96QA6 119 aa14.36□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 OSR2Q8N2R0 312 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZNF525Q8N782 197 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 SPSB1Q96BD6 273 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 IMMP2LQ96T52 175 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 MANBALQ9NQG1 85 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 LNP1A1A4G5 178 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 G3V3Y1 287 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 RBX1P62877 108 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.35□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 A0A0U1RQK1 487 aa14.34□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZNF320A2RRD8 509 aa14.34□□□□□ -0.11
GDE1-201ENST00000353258 TMEM250H0YL14 139 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms