RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GUH1 482 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R2P9O14990 202 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 RAMP3O60896 148 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CSF1P09603 554 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 VSIG8P0DPA2 414 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ATP1B3P54709 279 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ZP1P60852 638 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 MZT1Q08AG7 82 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 UNC119Q13432 240 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CEACAM21Q3KPI0 293 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SSX8Q7RTT4 187 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 OR2W3Q7Z3T1 314 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TMEM186Q96B77 213 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 RAB22AQ9UL26 194 aa5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TMEM14DPA8MWL7 114 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 IQCF6A8MYZ5 107 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CRYAAP02489 173 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 UBBP0CG47 229 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 GPR12P47775 334 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 AKR1C1Q04828 323 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 PSG7Q13046 419 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TMEM255AQ5JRV8 349 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 OR10K2Q6IF99 312 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 Q8N402 240 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 BEST4Q8NFU0 473 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 OR5P3Q8WZ94 311 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SFRP2Q96HF1 295 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 AUP1Q9Y679 476 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 XRCC3O43542 346 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 RP2O75695 350 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 HOXB5P09067 269 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TBPP20226 339 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 GNLYP22749 145 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CD40P25942 277 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ARF6P62330 175 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 FAAP24Q9BTP7 215 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.15□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 RAB29O14966 203 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 CTDSPLO15194 276 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 CDC14BO60729 498 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 RGS11O94810 467 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 TMEM225BP0DP42 221 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 FABP4P15090 132 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 CA6P23280 308 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 UQCRFS1P47985 274 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 TFPI2P48307 235 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 PTH2RP49190 550 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 GPM6AP51674 278 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 TAS2R20P59543 309 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 IGFBP7Q16270 282 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 MUC15Q8N387 334 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 TMEM185AQ8NFB2 350 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 OR5A2Q8NGI9 324 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 FZR1Q9UM11 496 aa5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 KITLGP21583 273 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 TLE1Q04724 770 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 CDSNQ15517 529 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 MICBQ29980 383 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 ASCL4Q6XD76 172 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 GLMPQ8WWB7 406 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 NPTNQ9Y639 398 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 ZNF732B4DXR9 585 aa5.14□□□□□ -1.59
CCR6-201ENST00000341935 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms