RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 NCMAPQ5T1S8 102 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 OR5D13Q8NGL4 314 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 OR13A1Q8NGR1 328 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 TOLLIPQ9H0E2 274 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 DEDDO75618 318 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV2-14P01704 120 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 CD55P08174 381 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 CD80P33681 288 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 FOXRED2Q8IWF2 684 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 TPRX1Q8N7U7 411 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 IL22RA2Q969J5 263 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 FAM90A27PA6NNH2 459 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 VSTM5A8MXK1 200 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 MGST3O14880 152 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 RLN2P04090 185 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 MSGN1A6NI15 193 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 C17orf100A8MU93 164 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 SCGB1D2O95969 90 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 EDDM3AQ14507 147 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 ZFP57Q9NU63 452 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 KCNS2Q9ULS6 477 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 SHISA9B4DS77 424 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 F5H0A9 414 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 MBPP02686 304 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 OR8U9P0C7N5 309 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 OR8U1Q8NH10 309 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 COQ3Q9NZJ6 369 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXD8-201ENST00000313173 K7N7A8 449 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 FAM201AQ5SY85 155 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 OR52L2PQ8NGH6 319 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 OR52M1Q8NGK5 317 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 SPIN2AQ99865 258 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ODAMA1E959 279 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 K7EPK0 472 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 TNFRSF1AP19438 455 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 SSTR5P35346 364 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 OR4D5Q8NGN0 318 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 OR51H1Q8NH63 302 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 NINJ1Q92982 152 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 PLPPR2Q96GM1 343 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 NKX2-6A6NCS4 301 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 GNMTQ14749 295 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 STUMQ69YW2 141 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ARL11Q969Q4 196 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 CITED4Q96RK1 184 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 AUP1Q9Y679 476 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 USP24Q9UPU5 2620 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 CACNA1DQ01668 2161 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 C15orf65H3BRN8 121 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 SPINT2O43291 252 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 IRF2P14316 349 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ADORA2A-AS1P86434 159 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 TLE1Q04724 770 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF561Q8N587 486 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ZNRF1Q8ND25 227 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 SDSLQ96GA7 329 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 KALRNO60229 2985 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 COL6A6A6NMZ7 2263 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 HKR1P10072 659 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 VDAC1P21796 283 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 DRAM1Q8N682 238 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 MARVELD3Q96A59 401 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 PHYHIPLQ96FC7 376 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 DCTN5Q9BTE1 182 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 NDRG3Q9UGV2 375 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 CCL8P80075 99 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 CR1LQ2VPA4 569 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 NMSQ5H8A3 153 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 FAM209AQ5JX71 171 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF645Q8N7E2 425 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 STOML3Q8TAV4 291 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 E5RGE8 158 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 E7EQL1 145 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ST8SIA3O43173 380 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 CRYZL1O95825 349 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 GZMHP20718 246 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 HTD2P86397 168 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB34Q8NCN2 500 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 OR2S2Q9NQN1 319 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 NSG2Q9Y328 171 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 POMT1Q9Y6A1 747 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXD8-201ENST00000313173 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms