RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 S1PR2O95136 353 aa8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 PMELP40967 661 aa8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 OR2A7Q96R45 310 aa8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 MIOXQ9UGB7 285 aa8.2□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.2□□□□□ -1.1
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CUX1-201ENST00000292535 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.19□□□□□ -1.1
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CUX1-201ENST00000292535 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.18□□□□□ -1.1
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CUX1-201ENST00000292535 SCMH1Q96GD3 660 aa8.18□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.18□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 SYNGR1O43759 233 aa8.18□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 SERF2P84101 59 aa8.18□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 C10orf128Q5T292 105 aa8.18□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 AHRRA9YTQ3 701 aa8.18□□□□□ -1.1
CUX1-201ENST00000292535 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
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