RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 ETFDHQ16134 617 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 SMIM8Q96KF7 97 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 HARBI1Q96MB7 349 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 CLN8Q9UBY8 286 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0J9YW62 118 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 HPXP02790 462 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 FUT5Q11128 374 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 OR2W5A6NFC9 320 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 PCOLCEQ15113 449 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 SYT8Q8NBV8 401 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 R4GN57 208 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRB-201ENST00000261266 LTBP1Q14766 1721 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 WNT9BO14905 357 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 UPK3AO75631 287 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 STPG1Q5TH74 334 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MS4A10Q96PG2 267 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 SCN1AP35498 2009 aa7.84□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 HELTA6NFD8 242 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 HYPMO75409 117 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CLDN18P56856 261 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PCSK4Q6UW60 755 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 SSX7Q7RTT5 188 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ZAR1Q86SH2 424 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TM2D1Q9BX74 207 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CDIPTO14735 213 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 BCL2P10415 239 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PMCHP20382 165 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 B2MP61769 119 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 GAMTQ14353 236 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PATJQ8NI35 1801 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TMPRSS2O15393 492 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 SP9P0CG40 484 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 MGAT2Q10469 447 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF146Q15072 292 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 FAM78BQ5VT40 261 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 UBALD1Q8TB05 177 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A22Q9H936 323 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 BET1LQ9NYM9 111 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GTH9 108 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 J3QR06 171 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 KLF4O43474 513 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CD1BP29016 333 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 AWAT1Q58HT5 328 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 OR4X1Q8NH49 305 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 H3BP45 60 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV3-11P04433 115 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 FAM87AP0C7U9 286 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PSG5Q15238 335 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 Q96M66 194 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 A6NDN8 102 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 H0Y8G0 127 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 COX7A1P24310 79 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 INSL4Q14641 139 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 LRP11Q86VZ4 500 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRB-201ENST00000261266 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.82□□□□□ -1.16
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