RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa18.17■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
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ODC1-201ENST00000234111 HOXB2P14652 356 aa18.17■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 PTTG1IPP53801 180 aa18.17■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 GFERP55789 205 aa18.17■□□□□ 0.5
ODC1-201ENST00000234111 LINC00310P59036 64 aa18.17■□□□□ 0.5
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ODC1-201ENST00000234111 NKX6-3A6NJ46 265 aa18.13■□□□□ 0.49
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ODC1-201ENST00000234111 WNT2P09544 360 aa18.13■□□□□ 0.49
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ODC1-201ENST00000234111 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa18.13■□□□□ 0.49
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ODC1-201ENST00000234111 TECTBQ96PL2 329 aa18.13■□□□□ 0.49
ODC1-201ENST00000234111 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
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ODC1-201ENST00000234111 C1QTNF9P0C862 333 aa18.12■□□□□ 0.49
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ODC1-201ENST00000234111 BPIFB3P59826 476 aa18.12■□□□□ 0.49
ODC1-201ENST00000234111 OR5AU1Q8NGC0 362 aa18.12■□□□□ 0.49
ODC1-201ENST00000234111 ELOVL5Q9NYP7 299 aa18.12■□□□□ 0.49
ODC1-201ENST00000234111 SHBQ15464 509 aa18.12■□□□□ 0.49
ODC1-201ENST00000234111 SPANXN5Q5MJ07 72 aa18.12■□□□□ 0.49
ODC1-201ENST00000234111 SGMS2Q8NHU3 365 aa18.12■□□□□ 0.49
ODC1-201ENST00000234111 PIAS2O75928 621 aa18.11■□□□□ 0.49
ODC1-201ENST00000234111 MPLP40238 635 aa18.11■□□□□ 0.49
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