RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pm20d2A3KG59 431 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm9047B9EJX3 177 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm43517E9PYS1 339 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm20939L7N243 523 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm9125P0DMR6 365 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cdx2P43241 311 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr11Q60890 313 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gpr135Q7TQP2 457 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Stk17bQ8BG48 372 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 CyrenQ8BHZ5 157 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem234Q8R1E7 140 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tm4sf5Q91XF2 196 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rcc1lQ9CYF5 461 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 HikeshiQ9DD02 197 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gpx2Q9JHC0 190 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 4931422A03RikA2BHN9 113 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam170bE9PXT9 378 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 AdmP97297 184 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mfsd4b3Q3UN21 355 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1173Q7TR24 312 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc17a5Q8BN82 495 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tctn3Q8R2Q6 595 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr187Q8VEX6 308 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr129Q8VEY1 330 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 UmodQ91X17 642 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hspb2Q99PR8 182 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Glo1Q9CPU0 184 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr716Q9EPG6 314 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr632Q9EPN9 317 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cryba2Q9JJV1 197 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Defb3Q9WTL0 63 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem196V9GX04 182 aa10.06□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cep250Q60952 2414 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr117L7N1Z1 317 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 P2rx6O54803 389 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bmi1P25916 324 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Upk2P38575 184 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pip5k1aP70182 546 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 VegfdP97946 358 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rhox4gQ2MDF7 205 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rhox4dQ2MDG0 205 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rhox4eQ504P9 205 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp30Q60585 533 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Grb2Q60631 217 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Smug1Q6P5C5 279 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dact2Q7TN08 757 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 TpppQ7TQD2 218 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr453Q7TRV7 317 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr654Q8VF27 341 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr130Q8VFC1 317 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pttg1Q9CQJ7 199 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Asb5Q9D1A4 329 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 1700025F22RikQ9D9Y7 111 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mcts1Q9DB27 181 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rhox4bQ9JI43 205 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Trip12G5E870 2025 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 DmdP11531 3678 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Col5a3Q9JLI2 1739 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1490A0A1L1SVH0 321 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 D7Ertd443eD2J0Y4 644 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 NrasP08556 189 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 InmtP40936 264 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kcng3P59053 433 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 B3gat2P59270 324 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rasl12Q08AT1 266 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm773Q3TML4 206 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem18Q3TUD9 140 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Q3UUX7 111 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 AbraclQ4KML4 81 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 MENTQ569E4 350 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Opn5Q6VZZ7 377 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp429Q7M6Y0 485 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Znf574Q8BY46 900 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rps19bp1Q8C6B9 143 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tceal3Q8R0A5 200 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr638Q8VH20 321 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cavin3Q91VJ2 260 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bbc3Q99ML1 193 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zcchc10Q9CX48 178 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rpl7l1Q9D8M4 246 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tceal6Q9DB24 200 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ndufa9Q9DC69 377 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sec16aA2AIX1 2377 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm42517A0A1Y7VLQ2 374 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm17657E9PWY5 170 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr628K7N6B2 316 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn2r60L7N2A1 853 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 P01822 137 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mdh2P08249 338 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 GbaP17439 515 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Scand1Q2M4I6 142 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp872Q3UVL3 465 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 4930451G09RikQ8C5G4 195 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cuedc1Q8R3V6 388 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 0610009B22RikQ8R3W2 140 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr113Q8VEU4 312 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1201Q8VGF5 307 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam210bQ9D8B6 190 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr943Q9EQ92 314 aa10.05□□□□□ -0.8
Herc4-201ENSMUST00000020258 P2ry4Q9JJS7 361 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.3 ms